Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.165e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-211ENST00000487873 464 ntTSL 313.82□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.81□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 213.81□□□□□ -0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.863e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.583e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-10■□□□□ 8.1
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ILF3Q12906 C6orf136-210ENST00000484551 613 ntTSL 316.38■□□□□ 0.213e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-213ENST00000493705 715 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 220.04■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-207ENST00000540763 799 ntTSL 319.2■□□□□ 0.666e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-211ENST00000544429 574 ntTSL 418.89■□□□□ 0.616e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-204ENST00000536079 765 ntTSL 217.64■□□□□ 0.416e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.266e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-212ENST00000544738 956 ntTSL 516.14■□□□□ 0.176e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-202ENST00000354291 1004 ntTSL 515.87■□□□□ 0.136e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-220ENST00000529455 840 ntTSL 515.24■□□□□ 0.036e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-226ENST00000532478 940 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-209ENST00000542286 2767 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DDX55-213ENST00000545042 450 ntTSL 513.2□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-214ENST00000527927 850 ntTSL 512.09□□□□□ -0.476e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-225ENST00000532438 740 ntTSL 411.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-205ENST00000524782 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-213ENST00000527776 709 ntTSL 210.17□□□□□ -0.786e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 ARFGAP2-210ENST00000526342 474 ntTSL 59.25□□□□□ -0.936e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 INO80-206ENST00000559995 566 ntTSL 54.46□□□□□ -1.76e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 218.53■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-204ENST00000484128 714 ntTSL 211.22□□□□□ -0.615e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-212ENST00000613292 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 311.11□□□□□ -0.635e-9■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.099e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 520.11■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.279e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 216.64■□□□□ 0.259e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.169e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-204ENST00000495422 624 ntTSL 514.02□□□□□ -0.179e-6■□□□□ 8
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ILF3Q12906 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 59.41□□□□□ -0.99e-6■□□□□ 8
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ILF3Q12906 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.059e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-206ENST00000527900 398 ntTSL 38.46□□□□□ -1.069e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.099e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.199e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.419e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.429e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.649e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 33.95□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 CHD7-205ENST00000527825 434 ntTSL 33.95□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-7■□□□□ 8
ILF3Q12906 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 8
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