RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577483.1

SSH2-205, Transcript of slingshot protein phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SSH2, Length 1,630 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2-205ENST00000577483 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
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SSH2-205ENST00000577483 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
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SSH2-205ENST00000577483 SMARCA2P51531 1590 aa24.43■■□□□ 1.5
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SSH2-205ENST00000577483 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.33■■□□□ 1.49
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SSH2-205ENST00000577483 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.47■■□□□ 1.35
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SSH2-205ENST00000577483 ABCC8Q09428 1581 aa23.01■■□□□ 1.27
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SSH2-205ENST00000577483 OSCARQ8IYS5 282 aa22.7■■□□□ 1.22
SSH2-205ENST00000577483 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.64■■□□□ 1.22
SSH2-205ENST00000577483 PBRM1Q86U86 1689 aa22.64■■□□□ 1.22
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SSH2-205ENST00000577483 SYNJ1O43426 1573 aa22.61■■□□□ 1.21
SSH2-205ENST00000577483 TOP2BQ02880 1626 aa22.59■■□□□ 1.21
SSH2-205ENST00000577483 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
SSH2-205ENST00000577483 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
SSH2-205ENST00000577483 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.57■■□□□ 1.2
SSH2-205ENST00000577483 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
SSH2-205ENST00000577483 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.56■■□□□ 1.2
SSH2-205ENST00000577483 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.54■■□□□ 1.2
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SSH2-205ENST00000577483 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.17■■□□□ 1.14
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SSH2-205ENST00000577483 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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