Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF13O43567 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF13O43567 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF13O43567 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF13O43567 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF13O43567 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF13O43567 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF13O43567 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF13O43567 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF13O43567 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF13O43567 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF13O43567 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF13O43567 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF13O43567 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF13O43567 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF13O43567 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF13O43567 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF13O43567 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF13O43567 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF13O43567 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF13O43567 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF13O43567 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF13O43567 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF13O43567 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF13O43567 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF13O43567 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF13O43567 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF13O43567 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF13O43567 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF13O43567 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF13O43567 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF13O43567 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF13O43567 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF13O43567 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF13O43567 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF13O43567 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF13O43567 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF13O43567 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF13O43567 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF13O43567 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF13O43567 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF13O43567 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF13O43567 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF13O43567 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF13O43567 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF13O43567 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF13O43567 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF13O43567 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF13O43567 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF13O43567 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF13O43567 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms