Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX25Q9UHL0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX25Q9UHL0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX25Q9UHL0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms