Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3P05106 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB3P05106 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGB3P05106 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms