Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
ITGB3P05106 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGB3P05106 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGB3P05106 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGB3P05106 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGB3P05106 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ITGB3P05106 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITGB3P05106 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGB3P05106 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB3P05106 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGB3P05106 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ITGB3P05106 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGB3P05106 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGB3P05106 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGB3P05106 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ITGB3P05106 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB3P05106 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITGB3P05106 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGB3P05106 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGB3P05106 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGB3P05106 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGB3P05106 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGB3P05106 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGB3P05106 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGB3P05106 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGB3P05106 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGB3P05106 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGB3P05106 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGB3P05106 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGB3P05106 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGB3P05106 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGB3P05106 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGB3P05106 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGB3P05106 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGB3P05106 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGB3P05106 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGB3P05106 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB3P05106 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGB3P05106 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGB3P05106 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGB3P05106 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGB3P05106 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITGB3P05106 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGB3P05106 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ITGB3P05106 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB3P05106 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ITGB3P05106 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITGB3P05106 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGB3P05106 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITGB3P05106 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITGB3P05106 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB3P05106 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGB3P05106 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGB3P05106 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB3P05106 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB3P05106 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB3P05106 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGB3P05106 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGB3P05106 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGB3P05106 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITGB3P05106 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGB3P05106 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGB3P05106 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGB3P05106 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGB3P05106 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGB3P05106 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGB3P05106 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ITGB3P05106 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGB3P05106 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ITGB3P05106 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGB3P05106 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITGB3P05106 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGB3P05106 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB3P05106 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGB3P05106 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGB3P05106 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGB3P05106 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB3P05106 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGB3P05106 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ITGB3P05106 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ITGB3P05106 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITGB3P05106 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITGB3P05106 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ITGB3P05106 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGB3P05106 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGB3P05106 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB3P05106 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGB3P05106 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms