RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589470.1

AC092296.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC092296.2, Length 999 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC092296.2-201ENST00000589470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.73■■■■■ 7.31
AC092296.2-201ENST00000589470 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.15■■■■■ 6.26
AC092296.2-201ENST00000589470 ABCC9O60706 1549 aa52.92■■■■■ 6.06
AC092296.2-201ENST00000589470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.94■■■■■ 5.75
AC092296.2-201ENST00000589470 NACADO15069 1562 aa50.87■■■■■ 5.73
AC092296.2-201ENST00000589470 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.59■■■■■ 5.69
AC092296.2-201ENST00000589470 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.57■■■■■ 5.69
AC092296.2-201ENST00000589470 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.54■■■■■ 5.68
AC092296.2-201ENST00000589470 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.31■■■■■ 5.64
AC092296.2-201ENST00000589470 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.91■■■■■ 5.58
AC092296.2-201ENST00000589470 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.46■■■■■ 5.51
AC092296.2-201ENST00000589470 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
AC092296.2-201ENST00000589470 SCRIBQ14160 1630 aa49.28■■■■■ 5.48
AC092296.2-201ENST00000589470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.93■■■■■ 5.42
AC092296.2-201ENST00000589470 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.69■■■■■ 5.38
AC092296.2-201ENST00000589470 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
AC092296.2-201ENST00000589470 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.95■■■■■ 5.27
AC092296.2-201ENST00000589470 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.59■■■■■ 5.21
AC092296.2-201ENST00000589470 SMARCA4P51532 1647 aa47.18■■■■■ 5.14
AC092296.2-201ENST00000589470 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
AC092296.2-201ENST00000589470 NCAPD3P42695 1498 aa46.92■■■■■ 5.1
AC092296.2-201ENST00000589470 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.9■■■■■ 5.1
AC092296.2-201ENST00000589470 SMARCA2P51531 1590 aa46.87■■■■■ 5.09
AC092296.2-201ENST00000589470 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.79■■■■■ 5.08
AC092296.2-201ENST00000589470 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.77■■■■■ 5.08
AC092296.2-201ENST00000589470 HMGXB3Q12766 1538 aa46.72■■■■■ 5.07
AC092296.2-201ENST00000589470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
AC092296.2-201ENST00000589470 WIZO95785 1651 aa46.3■■■■■ 5
AC092296.2-201ENST00000589470 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
AC092296.2-201ENST00000589470 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
AC092296.2-201ENST00000589470 NESP48681 1621 aa45.8■■■■■ 4.92
AC092296.2-201ENST00000589470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.73■■■■■ 4.91
AC092296.2-201ENST00000589470 ERCC6Q03468 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
AC092296.2-201ENST00000589470 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.49■■■■■ 4.87
AC092296.2-201ENST00000589470 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.35■■■■■ 4.85
AC092296.2-201ENST00000589470 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.34■■■■■ 4.85
AC092296.2-201ENST00000589470 CUX2O14529 1486 aa45.25■■■■■ 4.83
AC092296.2-201ENST00000589470 CFTRP13569 1480 aa45.24■■■■■ 4.83
AC092296.2-201ENST00000589470 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
AC092296.2-201ENST00000589470 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.22■■■■■ 4.83
AC092296.2-201ENST00000589470 PRDM2Q13029 1718 aa45.02■■■■■ 4.8
AC092296.2-201ENST00000589470 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.98■■■■■ 4.79
AC092296.2-201ENST00000589470 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.95■■■■■ 4.79
AC092296.2-201ENST00000589470 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.92■■■■■ 4.78
AC092296.2-201ENST00000589470 WDR62O43379 1518 aa44.83■■■■■ 4.77
AC092296.2-201ENST00000589470 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
AC092296.2-201ENST00000589470 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
AC092296.2-201ENST00000589470 TOPBP1Q92547 1522 aa44.28■■■■■ 4.68
AC092296.2-201ENST00000589470 ABCC8Q09428 1581 aa44.26■■■■■ 4.68
AC092296.2-201ENST00000589470 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.24■■■■■ 4.67
AC092296.2-201ENST00000589470 IFT140Q96RY7 1462 aa44.01■■■■■ 4.64
AC092296.2-201ENST00000589470 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.95■■■■■ 4.63
AC092296.2-201ENST00000589470 CUX1P39880 1505 aa43.92■■■■■ 4.62
AC092296.2-201ENST00000589470 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
AC092296.2-201ENST00000589470 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
AC092296.2-201ENST00000589470 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
AC092296.2-201ENST00000589470 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.75■■■■■ 4.59
AC092296.2-201ENST00000589470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
AC092296.2-201ENST00000589470 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.65■■■■■ 4.58
AC092296.2-201ENST00000589470 SOGA1O94964 1423 aa43.65■■■■■ 4.58
AC092296.2-201ENST00000589470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.55■■■■■ 4.56
AC092296.2-201ENST00000589470 WDR97A6NE52 1622 aa43.53■■■■■ 4.56
AC092296.2-201ENST00000589470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.52■■■■■ 4.56
AC092296.2-201ENST00000589470 TOP2BQ02880 1626 aa43.52■■■■■ 4.56
AC092296.2-201ENST00000589470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.52■■■■■ 4.56
AC092296.2-201ENST00000589470 SYNJ1O43426 1573 aa43.49■■■■■ 4.55
AC092296.2-201ENST00000589470 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
AC092296.2-201ENST00000589470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.35■■■■■ 4.53
AC092296.2-201ENST00000589470 OSCARQ8IYS5 282 aa43.25■■■■■ 4.51
AC092296.2-201ENST00000589470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.24■■■■■ 4.51
AC092296.2-201ENST00000589470 CHD1O14646 1710 aa43.2■■■■■ 4.51
AC092296.2-201ENST00000589470 GRIN2BQ13224 1484 aa43.19■■■■■ 4.51
AC092296.2-201ENST00000589470 PBRM1Q86U86 1689 aa43.19■■■■■ 4.5
AC092296.2-201ENST00000589470 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.18■■■■■ 4.5
AC092296.2-201ENST00000589470 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.15■■■■■ 4.5
AC092296.2-201ENST00000589470 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
AC092296.2-201ENST00000589470 SYNJ2O15056 1496 aa42.94■■■■■ 4.47
AC092296.2-201ENST00000589470 FBLN2P98095 1184 aa42.9■■■■■ 4.46
AC092296.2-201ENST00000589470 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.84■■■■■ 4.45
AC092296.2-201ENST00000589470 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
AC092296.2-201ENST00000589470 ADAMTS12P58397 1594 aa42.82■■■■■ 4.44
AC092296.2-201ENST00000589470 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.72■■■■■ 4.43
AC092296.2-201ENST00000589470 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
AC092296.2-201ENST00000589470 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
AC092296.2-201ENST00000589470 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
AC092296.2-201ENST00000589470 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.67■■■■■ 4.42
AC092296.2-201ENST00000589470 GRIN2AQ12879 1464 aa42.66■■■■■ 4.42
AC092296.2-201ENST00000589470 ARHGEF11O15085 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
AC092296.2-201ENST00000589470 KIF27Q86VH2 1401 aa42.62■■■■■ 4.41
AC092296.2-201ENST00000589470 NUP160Q12769 1436 aa42.49■■■■■ 4.39
AC092296.2-201ENST00000589470 CEP170Q5SW79 1584 aa42.48■■■■■ 4.39
AC092296.2-201ENST00000589470 IGF1RP08069 1367 aa42.47■■■■■ 4.39
AC092296.2-201ENST00000589470 CUL7Q14999 1698 aa42.45■■■■■ 4.39
AC092296.2-201ENST00000589470 TRIM41Q8WV44 630 aa42.34■■■■■ 4.37
AC092296.2-201ENST00000589470 ARAP1Q96P48 1450 aa42.3■■■■■ 4.36
AC092296.2-201ENST00000589470 SHROOM2Q13796 1616 aa42.25■■■■■ 4.35
AC092296.2-201ENST00000589470 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.2■■■■■ 4.35
AC092296.2-201ENST00000589470 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.19■■■■■ 4.34
AC092296.2-201ENST00000589470 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.13■■■■■ 4.33
AC092296.2-201ENST00000589470 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.09■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms