Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV3-11P04433 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGKV3-11P04433 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-11P04433 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms