Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
IGKV3-11P04433 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IGKV3-11P04433 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
IGKV3-11P04433 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IGKV3-11P04433 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IGKV3-11P04433 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGKV3-11P04433 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IGKV3-11P04433 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IGKV3-11P04433 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGKV3-11P04433 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGKV3-11P04433 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGKV3-11P04433 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGKV3-11P04433 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGKV3-11P04433 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGKV3-11P04433 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGKV3-11P04433 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGKV3-11P04433 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGKV3-11P04433 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGKV3-11P04433 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IGKV3-11P04433 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGKV3-11P04433 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGKV3-11P04433 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGKV3-11P04433 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGKV3-11P04433 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGKV3-11P04433 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGKV3-11P04433 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGKV3-11P04433 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGKV3-11P04433 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGKV3-11P04433 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV3-11P04433 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV3-11P04433 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGKV3-11P04433 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV3-11P04433 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV3-11P04433 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV3-11P04433 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGKV3-11P04433 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGKV3-11P04433 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGKV3-11P04433 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGKV3-11P04433 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGKV3-11P04433 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGKV3-11P04433 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGKV3-11P04433 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGKV3-11P04433 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGKV3-11P04433 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGKV3-11P04433 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGKV3-11P04433 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGKV3-11P04433 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGKV3-11P04433 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGKV3-11P04433 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGKV3-11P04433 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGKV3-11P04433 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGKV3-11P04433 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGKV3-11P04433 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGKV3-11P04433 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IGKV3-11P04433 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGKV3-11P04433 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGKV3-11P04433 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGKV3-11P04433 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGKV3-11P04433 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGKV3-11P04433 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGKV3-11P04433 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGKV3-11P04433 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IGKV3-11P04433 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGKV3-11P04433 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGKV3-11P04433 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGKV3-11P04433 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGKV3-11P04433 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGKV3-11P04433 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGKV3-11P04433 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IGKV3-11P04433 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGKV3-11P04433 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGKV3-11P04433 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGKV3-11P04433 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGKV3-11P04433 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGKV3-11P04433 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGKV3-11P04433 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGKV3-11P04433 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGKV3-11P04433 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGKV3-11P04433 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGKV3-11P04433 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGKV3-11P04433 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV3-11P04433 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV3-11P04433 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV3-11P04433 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV3-11P04433 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV3-11P04433 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV3-11P04433 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGKV3-11P04433 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGKV3-11P04433 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGKV3-11P04433 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGKV3-11P04433 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGKV3-11P04433 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGKV3-11P04433 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGKV3-11P04433 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGKV3-11P04433 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGKV3-11P04433 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGKV3-11P04433 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGKV3-11P04433 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IGKV3-11P04433 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGKV3-11P04433 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms