Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNC2P02585 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC2P02585 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNC2P02585 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNC2P02585 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms