Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNSO60931 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNSO60931 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNSO60931 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNSO60931 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNSO60931 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNSO60931 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNSO60931 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNSO60931 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNSO60931 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNSO60931 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNSO60931 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNSO60931 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNSO60931 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNSO60931 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNSO60931 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNSO60931 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNSO60931 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNSO60931 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNSO60931 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNSO60931 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNSO60931 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNSO60931 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNSO60931 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNSO60931 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNSO60931 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNSO60931 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNSO60931 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNSO60931 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNSO60931 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNSO60931 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNSO60931 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNSO60931 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNSO60931 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNSO60931 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNSO60931 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNSO60931 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNSO60931 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNSO60931 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNSO60931 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNSO60931 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNSO60931 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNSO60931 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNSO60931 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNSO60931 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNSO60931 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNSO60931 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNSO60931 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNSO60931 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms