Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL13O43927 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL13O43927 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCL13O43927 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL13O43927 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms