Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT2Q6UVM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNT2Q6UVM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms