RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298585.2

ZMYND19-201, Transcript of zinc finger MYND-type containing 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZMYND19, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND19-201ENST00000298585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.3■■■■■ 7.24
ZMYND19-201ENST00000298585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.74■■■■■ 6.19
ZMYND19-201ENST00000298585 ABCC9O60706 1549 aa53.2■■■■■ 6.11
ZMYND19-201ENST00000298585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.88■■■■■ 5.74
ZMYND19-201ENST00000298585 NACADO15069 1562 aa50.71■■■■■ 5.71
ZMYND19-201ENST00000298585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.68■■■■■ 5.7
ZMYND19-201ENST00000298585 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.24■■■■■ 5.63
ZMYND19-201ENST00000298585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
ZMYND19-201ENST00000298585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.83■■■■■ 5.57
ZMYND19-201ENST00000298585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.72■■■■■ 5.55
ZMYND19-201ENST00000298585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.7■■■■■ 5.553e-6■■■■□ 23.3
ZMYND19-201ENST00000298585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.44■■■■■ 5.51
ZMYND19-201ENST00000298585 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.42■■■■■ 5.5
ZMYND19-201ENST00000298585 SCRIBQ14160 1630 aa49.04■■■■■ 5.44
ZMYND19-201ENST00000298585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.75■■■■■ 5.39
ZMYND19-201ENST00000298585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
ZMYND19-201ENST00000298585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.07■■■■■ 5.29
ZMYND19-201ENST00000298585 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.84■■■■■ 5.25
ZMYND19-201ENST00000298585 SMARCA4P51532 1647 aa46.86■■■■■ 5.09
ZMYND19-201ENST00000298585 NCAPD3P42695 1498 aa46.86■■■■■ 5.09
ZMYND19-201ENST00000298585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
ZMYND19-201ENST00000298585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
ZMYND19-201ENST00000298585 SMARCA2P51531 1590 aa46.65■■■■■ 5.06
ZMYND19-201ENST00000298585 HMGXB3Q12766 1538 aa46.49■■■■■ 5.03
ZMYND19-201ENST00000298585 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.48■■■■■ 5.03
ZMYND19-201ENST00000298585 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.41■■■■■ 5.02
ZMYND19-201ENST00000298585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
ZMYND19-201ENST00000298585 WIZO95785 1651 aa45.93■■■■■ 4.94
ZMYND19-201ENST00000298585 NESP48681 1621 aa45.9■■■■■ 4.94
ZMYND19-201ENST00000298585 ERCC6Q03468 1493 aa45.85■■■■■ 4.93
ZMYND19-201ENST00000298585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
ZMYND19-201ENST00000298585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.63■■■■■ 4.9
ZMYND19-201ENST00000298585 CUX2O14529 1486 aa45.55■■■■■ 4.88
ZMYND19-201ENST00000298585 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.47■■■■■ 4.87
ZMYND19-201ENST00000298585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.38■■■■■ 4.86
ZMYND19-201ENST00000298585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.85
ZMYND19-201ENST00000298585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.26■■■■■ 4.84
ZMYND19-201ENST00000298585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
ZMYND19-201ENST00000298585 CFTRP13569 1480 aa45.06■■■■■ 4.8
ZMYND19-201ENST00000298585 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.93■■■■■ 4.78
ZMYND19-201ENST00000298585 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.92■■■■■ 4.78
ZMYND19-201ENST00000298585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.91■■■■■ 4.78
ZMYND19-201ENST00000298585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.9■■■■■ 4.78
ZMYND19-201ENST00000298585 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.88■■■■■ 4.77
ZMYND19-201ENST00000298585 WDR62O43379 1518 aa44.79■■■■■ 4.76
ZMYND19-201ENST00000298585 PRDM2Q13029 1718 aa44.56■■■■■ 4.72
ZMYND19-201ENST00000298585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
ZMYND19-201ENST00000298585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
ZMYND19-201ENST00000298585 TOPBP1Q92547 1522 aa44.14■■■■■ 4.66
ZMYND19-201ENST00000298585 ABCC8Q09428 1581 aa44.08■■■■■ 4.65
ZMYND19-201ENST00000298585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44■■■■■ 4.63
ZMYND19-201ENST00000298585 IFT140Q96RY7 1462 aa43.97■■■■■ 4.63
ZMYND19-201ENST00000298585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
ZMYND19-201ENST00000298585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
ZMYND19-201ENST00000298585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
ZMYND19-201ENST00000298585 OSCARQ8IYS5 282 aa43.67■■■■■ 4.58
ZMYND19-201ENST00000298585 CUX1P39880 1505 aa43.62■■■■■ 4.57
ZMYND19-201ENST00000298585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
ZMYND19-201ENST00000298585 SOGA1O94964 1423 aa43.58■■■■■ 4.57
ZMYND19-201ENST00000298585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.58■■■■■ 4.57
ZMYND19-201ENST00000298585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.574e-7■■■■□ 26.3
ZMYND19-201ENST00000298585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.54■■■■■ 4.56
ZMYND19-201ENST00000298585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
ZMYND19-201ENST00000298585 WDR97A6NE52 1622 aa43.23■■■■■ 4.51
ZMYND19-201ENST00000298585 FBLN2P98095 1184 aa43.16■■■■■ 4.5
ZMYND19-201ENST00000298585 TRIM41Q8WV44 630 aa43.16■■■■■ 4.5
ZMYND19-201ENST00000298585 CHD1O14646 1710 aa43.14■■■■■ 4.5
ZMYND19-201ENST00000298585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
ZMYND19-201ENST00000298585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.1■■■■■ 4.49
ZMYND19-201ENST00000298585 GRIN2BQ13224 1484 aa43.09■■■■■ 4.49
ZMYND19-201ENST00000298585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.09■■■■■ 4.49
ZMYND19-201ENST00000298585 TOP2BQ02880 1626 aa43.07■■■■■ 4.49
ZMYND19-201ENST00000298585 SYNJ1O43426 1573 aa43.05■■■■■ 4.48
ZMYND19-201ENST00000298585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.05■■■■■ 4.48
ZMYND19-201ENST00000298585 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.03■■■■■ 4.48
ZMYND19-201ENST00000298585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
ZMYND19-201ENST00000298585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
ZMYND19-201ENST00000298585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.94■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.94■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.94■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.93■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 PBRM1Q86U86 1689 aa42.89■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 ARHGEF11O15085 1522 aa42.89■■■■■ 4.46
ZMYND19-201ENST00000298585 SYNJ2O15056 1496 aa42.86■■■■■ 4.45
ZMYND19-201ENST00000298585 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.69■■■■■ 4.43
ZMYND19-201ENST00000298585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.62■■■■■ 4.41
ZMYND19-201ENST00000298585 ADAMTS12P58397 1594 aa42.55■■■■■ 4.4
ZMYND19-201ENST00000298585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
ZMYND19-201ENST00000298585 GRIN2AQ12879 1464 aa42.53■■■■■ 4.4
ZMYND19-201ENST00000298585 ARAP1Q96P48 1450 aa42.52■■■■■ 4.4
ZMYND19-201ENST00000298585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.51■■■■■ 4.4
ZMYND19-201ENST00000298585 NUP160Q12769 1436 aa42.38■■■■■ 4.37
ZMYND19-201ENST00000298585 CEP170Q5SW79 1584 aa42.34■■■■■ 4.37
ZMYND19-201ENST00000298585 KIF27Q86VH2 1401 aa42.27■■■■■ 4.36
ZMYND19-201ENST00000298585 IGF1RP08069 1367 aa42.24■■■■■ 4.35
ZMYND19-201ENST00000298585 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.11■■■■■ 4.33
ZMYND19-201ENST00000298585 SHROOM2Q13796 1616 aa42.08■■■■■ 4.33
ZMYND19-201ENST00000298585 CUL7Q14999 1698 aa42.02■■■■■ 4.32
ZMYND19-201ENST00000298585 JPH4Q96JJ6 628 aa42.01■■■■■ 4.32
ZMYND19-201ENST00000298585 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms