RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594800.5

RAB4B-203, Transcript of RAB4B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RAB4B, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4B-203ENST00000594800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.27■■■■■ 7.24
RAB4B-203ENST00000594800 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54■■■■■ 6.23
RAB4B-203ENST00000594800 ABCC9O60706 1549 aa53.64■■■■■ 6.18
RAB4B-203ENST00000594800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.22■■■■■ 5.79
RAB4B-203ENST00000594800 NACADO15069 1562 aa50.94■■■■■ 5.75
RAB4B-203ENST00000594800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.67■■■■■ 5.7
RAB4B-203ENST00000594800 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.35■■■■■ 5.65
RAB4B-203ENST00000594800 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.13■■■■■ 5.62
RAB4B-203ENST00000594800 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
RAB4B-203ENST00000594800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.02■■■■■ 5.6
RAB4B-203ENST00000594800 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.95■■■■■ 5.59
RAB4B-203ENST00000594800 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.81■■■■■ 5.56
RAB4B-203ENST00000594800 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.73■■■■■ 5.55
RAB4B-203ENST00000594800 SCRIBQ14160 1630 aa49.2■■■■■ 5.47
RAB4B-203ENST00000594800 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.07■■■■■ 5.45
RAB4B-203ENST00000594800 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.5■■■■■ 5.36
RAB4B-203ENST00000594800 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
RAB4B-203ENST00000594800 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.29■■■■■ 5.32
RAB4B-203ENST00000594800 NCAPD3P42695 1498 aa47.01■■■■■ 5.12
RAB4B-203ENST00000594800 SMARCA4P51532 1647 aa46.97■■■■■ 5.11
RAB4B-203ENST00000594800 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.91■■■■■ 5.1
RAB4B-203ENST00000594800 SMARCA2P51531 1590 aa46.81■■■■■ 5.08
RAB4B-203ENST00000594800 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
RAB4B-203ENST00000594800 HMGXB3Q12766 1538 aa46.71■■■■■ 5.07
RAB4B-203ENST00000594800 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.52■■■■■ 5.04
RAB4B-203ENST00000594800 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
RAB4B-203ENST00000594800 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.45■■■■■ 5.03
RAB4B-203ENST00000594800 ERCC6Q03468 1493 aa46.28■■■■■ 5
RAB4B-203ENST00000594800 NESP48681 1621 aa46.17■■■■■ 4.98
RAB4B-203ENST00000594800 CUX2O14529 1486 aa46.11■■■■■ 4.97
RAB4B-203ENST00000594800 WIZO95785 1651 aa45.93■■■■■ 4.94
RAB4B-203ENST00000594800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.92■■■■■ 4.94
RAB4B-203ENST00000594800 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.7■■■■■ 4.91
RAB4B-203ENST00000594800 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
RAB4B-203ENST00000594800 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.64■■■■■ 4.9
RAB4B-203ENST00000594800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.6■■■■■ 4.89
RAB4B-203ENST00000594800 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
RAB4B-203ENST00000594800 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.58■■■■■ 4.89
RAB4B-203ENST00000594800 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
RAB4B-203ENST00000594800 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.22■■■■■ 4.83
RAB4B-203ENST00000594800 CFTRP13569 1480 aa45.14■■■■■ 4.82
RAB4B-203ENST00000594800 WDR62O43379 1518 aa45.11■■■■■ 4.81
RAB4B-203ENST00000594800 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.1■■■■■ 4.81
RAB4B-203ENST00000594800 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.08■■■■■ 4.81
RAB4B-203ENST00000594800 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.82■■■■■ 4.77
RAB4B-203ENST00000594800 PRDM2Q13029 1718 aa44.81■■■■■ 4.76
RAB4B-203ENST00000594800 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
RAB4B-203ENST00000594800 TOPBP1Q92547 1522 aa44.27■■■■■ 4.68
RAB4B-203ENST00000594800 ABCC8Q09428 1581 aa44.18■■■■■ 4.66
RAB4B-203ENST00000594800 IFT140Q96RY7 1462 aa44.18■■■■■ 4.66
RAB4B-203ENST00000594800 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.14■■■■■ 4.66
RAB4B-203ENST00000594800 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
RAB4B-203ENST00000594800 OSCARQ8IYS5 282 aa44.02■■■■■ 4.64
RAB4B-203ENST00000594800 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
RAB4B-203ENST00000594800 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
RAB4B-203ENST00000594800 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
RAB4B-203ENST00000594800 TRIM41Q8WV44 630 aa43.81■■■■■ 4.6
RAB4B-203ENST00000594800 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
RAB4B-203ENST00000594800 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.71■■■■■ 4.592e-6■■□□□ 13
RAB4B-203ENST00000594800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.66■■■■■ 4.58
RAB4B-203ENST00000594800 CUX1P39880 1505 aa43.63■■■■■ 4.57
RAB4B-203ENST00000594800 SOGA1O94964 1423 aa43.62■■■■■ 4.57
RAB4B-203ENST00000594800 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.61■■■■■ 4.57
RAB4B-203ENST00000594800 CHD1O14646 1710 aa43.53■■■■■ 4.56
RAB4B-203ENST00000594800 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
RAB4B-203ENST00000594800 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.48■■■■■ 4.55
RAB4B-203ENST00000594800 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.48■■■■■ 4.55
RAB4B-203ENST00000594800 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.48■■■■■ 4.55
RAB4B-203ENST00000594800 WDR97A6NE52 1622 aa43.45■■■■■ 4.55
RAB4B-203ENST00000594800 ARHGEF11O15085 1522 aa43.36■■■■■ 4.53
RAB4B-203ENST00000594800 FBLN2P98095 1184 aa43.34■■■■■ 4.53
RAB4B-203ENST00000594800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB4B-203ENST00000594800 GRIN2BQ13224 1484 aa43.22■■■■■ 4.51
RAB4B-203ENST00000594800 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.51
RAB4B-203ENST00000594800 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.13■■■■■ 4.5
RAB4B-203ENST00000594800 PBRM1Q86U86 1689 aa43.13■■■■■ 4.49
RAB4B-203ENST00000594800 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.11■■■■■ 4.49
RAB4B-203ENST00000594800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
RAB4B-203ENST00000594800 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.07■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 SYNJ2O15056 1496 aa43.05■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.04■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 TOP2BQ02880 1626 aa43.02■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 SYNJ1O43426 1573 aa43.01■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.01■■■■■ 4.48
RAB4B-203ENST00000594800 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43■■■■■ 4.47
RAB4B-203ENST00000594800 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.97■■■■■ 4.47
RAB4B-203ENST00000594800 ARAP1Q96P48 1450 aa42.94■■■■■ 4.47
RAB4B-203ENST00000594800 ADAMTS12P58397 1594 aa42.71■■■■■ 4.43
RAB4B-203ENST00000594800 GRIN2AQ12879 1464 aa42.68■■■■■ 4.42
RAB4B-203ENST00000594800 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.6■■■■■ 4.41
RAB4B-203ENST00000594800 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.57■■■■■ 4.41
RAB4B-203ENST00000594800 CEP170Q5SW79 1584 aa42.52■■■■■ 4.4
RAB4B-203ENST00000594800 NUP160Q12769 1436 aa42.52■■■■■ 4.4
RAB4B-203ENST00000594800 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
RAB4B-203ENST00000594800 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.36■■■■■ 4.37
RAB4B-203ENST00000594800 SHROOM2Q13796 1616 aa42.32■■■■■ 4.37
RAB4B-203ENST00000594800 KIF27Q86VH2 1401 aa42.15■■■■■ 4.34
RAB4B-203ENST00000594800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.11■■■■■ 4.33
RAB4B-203ENST00000594800 IGF1RP08069 1367 aa42.1■■■■■ 4.33
RAB4B-203ENST00000594800 CUL7Q14999 1698 aa42.06■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms