RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513615.5

QDPR-208, Transcript of quinoid dihydropteridine reductase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene QDPR, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QDPR-208ENST00000513615 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.41■■■■■ 7.26
QDPR-208ENST00000513615 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.15■■■■■ 6.26
QDPR-208ENST00000513615 ABCC9O60706 1549 aa54.05■■■■■ 6.24
QDPR-208ENST00000513615 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.51■■■■■ 5.84
QDPR-208ENST00000513615 NACADO15069 1562 aa51.19■■■■■ 5.78
QDPR-208ENST00000513615 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.93■■■■■ 5.74
QDPR-208ENST00000513615 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.64■■■■■ 5.7
QDPR-208ENST00000513615 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.54■■■■■ 5.68
QDPR-208ENST00000513615 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.35■■■■■ 5.65
QDPR-208ENST00000513615 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.29■■■■■ 5.64
QDPR-208ENST00000513615 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
QDPR-208ENST00000513615 BICRAQ9NZM4 1560 aa50■■■■■ 5.59
QDPR-208ENST00000513615 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.92■■■■■ 5.58
QDPR-208ENST00000513615 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.37■■■■■ 5.49
QDPR-208ENST00000513615 SCRIBQ14160 1630 aa49.33■■■■■ 5.49
QDPR-208ENST00000513615 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.83■■■■■ 5.41
QDPR-208ENST00000513615 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
QDPR-208ENST00000513615 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.7■■■■■ 5.39
QDPR-208ENST00000513615 NCAPD3P42695 1498 aa47.27■■■■■ 5.16
QDPR-208ENST00000513615 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.13■■■■■ 5.13
QDPR-208ENST00000513615 SMARCA4P51532 1647 aa47.08■■■■■ 5.13
QDPR-208ENST00000513615 SMARCA2P51531 1590 aa47■■■■■ 5.11
QDPR-208ENST00000513615 HMGXB3Q12766 1538 aa46.91■■■■■ 5.1
QDPR-208ENST00000513615 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.1
QDPR-208ENST00000513615 ERCC6Q03468 1493 aa46.67■■■■■ 5.06
QDPR-208ENST00000513615 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
QDPR-208ENST00000513615 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.65■■■■■ 5.06
QDPR-208ENST00000513615 CUX2O14529 1486 aa46.57■■■■■ 5.05
QDPR-208ENST00000513615 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.53■■■■■ 5.04
QDPR-208ENST00000513615 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.46■■■■■ 5.03
QDPR-208ENST00000513615 NESP48681 1621 aa46.46■■■■■ 5.03
QDPR-208ENST00000513615 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.18■■■■■ 4.98
QDPR-208ENST00000513615 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
QDPR-208ENST00000513615 WIZO95785 1651 aa45.96■■■■■ 4.95
QDPR-208ENST00000513615 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.92■■■■■ 4.94
QDPR-208ENST00000513615 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.84■■■■■ 4.93
QDPR-208ENST00000513615 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.84■■■■■ 4.93
QDPR-208ENST00000513615 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
QDPR-208ENST00000513615 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.5■■■■■ 4.87
QDPR-208ENST00000513615 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
QDPR-208ENST00000513615 WDR62O43379 1518 aa45.38■■■■■ 4.86
QDPR-208ENST00000513615 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.34■■■■■ 4.85
QDPR-208ENST00000513615 CFTRP13569 1480 aa45.33■■■■■ 4.85
QDPR-208ENST00000513615 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.29■■■■■ 4.84
QDPR-208ENST00000513615 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
QDPR-208ENST00000513615 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.91■■■■■ 4.78
QDPR-208ENST00000513615 PRDM2Q13029 1718 aa44.83■■■■■ 4.77
QDPR-208ENST00000513615 OSCARQ8IYS5 282 aa44.48■■■■■ 4.71
QDPR-208ENST00000513615 TOPBP1Q92547 1522 aa44.45■■■■■ 4.71
QDPR-208ENST00000513615 IFT140Q96RY7 1462 aa44.44■■■■■ 4.7
QDPR-208ENST00000513615 TRIM41Q8WV44 630 aa44.42■■■■■ 4.7
QDPR-208ENST00000513615 ABCC8Q09428 1581 aa44.39■■■■■ 4.7
QDPR-208ENST00000513615 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
QDPR-208ENST00000513615 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.29■■■■■ 4.68
QDPR-208ENST00000513615 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
QDPR-208ENST00000513615 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
QDPR-208ENST00000513615 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
QDPR-208ENST00000513615 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.96■■■■■ 4.631e-6■■■■■ 30.9
QDPR-208ENST00000513615 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.84■■■■■ 4.61
QDPR-208ENST00000513615 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.84■■■■■ 4.61
QDPR-208ENST00000513615 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.84■■■■■ 4.61
QDPR-208ENST00000513615 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.83■■■■■ 4.61
QDPR-208ENST00000513615 SOGA1O94964 1423 aa43.82■■■■■ 4.6
QDPR-208ENST00000513615 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.74■■■■■ 4.59
QDPR-208ENST00000513615 ARHGEF11O15085 1522 aa43.73■■■■■ 4.59
QDPR-208ENST00000513615 CHD1O14646 1710 aa43.73■■■■■ 4.59
QDPR-208ENST00000513615 CUX1P39880 1505 aa43.72■■■■■ 4.59
QDPR-208ENST00000513615 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
QDPR-208ENST00000513615 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
QDPR-208ENST00000513615 FBLN2P98095 1184 aa43.65■■■■■ 4.58
QDPR-208ENST00000513615 WDR97A6NE52 1622 aa43.62■■■■■ 4.57
QDPR-208ENST00000513615 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.51■■■■■ 4.56
QDPR-208ENST00000513615 GRIN2BQ13224 1484 aa43.43■■■■■ 4.54
QDPR-208ENST00000513615 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.42■■■■■ 4.54
QDPR-208ENST00000513615 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
QDPR-208ENST00000513615 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
QDPR-208ENST00000513615 ARAP1Q96P48 1450 aa43.32■■■■■ 4.52
QDPR-208ENST00000513615 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.28■■■■■ 4.52
QDPR-208ENST00000513615 SYNJ2O15056 1496 aa43.27■■■■■ 4.52
QDPR-208ENST00000513615 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
QDPR-208ENST00000513615 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.27■■■■■ 4.52
QDPR-208ENST00000513615 SYNJ1O43426 1573 aa43.25■■■■■ 4.51
QDPR-208ENST00000513615 PBRM1Q86U86 1689 aa43.21■■■■■ 4.51
QDPR-208ENST00000513615 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.17■■■■■ 4.5
QDPR-208ENST00000513615 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.49
QDPR-208ENST00000513615 TOP2BQ02880 1626 aa43.04■■■■■ 4.48
QDPR-208ENST00000513615 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.04■■■■■ 4.48
QDPR-208ENST00000513615 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
QDPR-208ENST00000513615 GRIN2AQ12879 1464 aa42.87■■■■■ 4.45
QDPR-208ENST00000513615 ADAMTS12P58397 1594 aa42.84■■■■■ 4.45
QDPR-208ENST00000513615 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.75■■■■■ 4.43
QDPR-208ENST00000513615 NUP160Q12769 1436 aa42.73■■■■■ 4.43
QDPR-208ENST00000513615 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.72■■■■■ 4.43
QDPR-208ENST00000513615 CEP170Q5SW79 1584 aa42.69■■■■■ 4.42
QDPR-208ENST00000513615 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.58■■■■■ 4.41
QDPR-208ENST00000513615 SHROOM2Q13796 1616 aa42.5■■■■■ 4.39
QDPR-208ENST00000513615 JPH4Q96JJ6 628 aa42.31■■■■■ 4.36
QDPR-208ENST00000513615 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
QDPR-208ENST00000513615 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.23■■■■■ 4.35
QDPR-208ENST00000513615 KIF27Q86VH2 1401 aa42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms