Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC24A3Q9HC58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC24A3Q9HC58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC24A3Q9HC58 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC24A3Q9HC58 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC24A3Q9HC58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC24A3Q9HC58 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC24A3Q9HC58 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC24A3Q9HC58 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC24A3Q9HC58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC24A3Q9HC58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC24A3Q9HC58 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC24A3Q9HC58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC24A3Q9HC58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC24A3Q9HC58 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC24A3Q9HC58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC24A3Q9HC58 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC24A3Q9HC58 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC24A3Q9HC58 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC24A3Q9HC58 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC24A3Q9HC58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC24A3Q9HC58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC24A3Q9HC58 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC24A3Q9HC58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC24A3Q9HC58 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC24A3Q9HC58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC24A3Q9HC58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A3Q9HC58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC24A3Q9HC58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC24A3Q9HC58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC24A3Q9HC58 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC24A3Q9HC58 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC24A3Q9HC58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC24A3Q9HC58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC24A3Q9HC58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC24A3Q9HC58 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC24A3Q9HC58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC24A3Q9HC58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC24A3Q9HC58 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC24A3Q9HC58 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC24A3Q9HC58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC24A3Q9HC58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC24A3Q9HC58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC24A3Q9HC58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms