Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC24A3Q9HC58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC24A3Q9HC58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC24A3Q9HC58 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC24A3Q9HC58 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC24A3Q9HC58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC24A3Q9HC58 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC24A3Q9HC58 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC24A3Q9HC58 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC24A3Q9HC58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC24A3Q9HC58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC24A3Q9HC58 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC24A3Q9HC58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC24A3Q9HC58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC24A3Q9HC58 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC24A3Q9HC58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC24A3Q9HC58 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC24A3Q9HC58 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC24A3Q9HC58 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC24A3Q9HC58 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC24A3Q9HC58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC24A3Q9HC58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC24A3Q9HC58 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC24A3Q9HC58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC24A3Q9HC58 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC24A3Q9HC58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC24A3Q9HC58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC24A3Q9HC58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC24A3Q9HC58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC24A3Q9HC58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC24A3Q9HC58 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC24A3Q9HC58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC24A3Q9HC58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC24A3Q9HC58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC24A3Q9HC58 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC24A3Q9HC58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC24A3Q9HC58 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC24A3Q9HC58 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC24A3Q9HC58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC24A3Q9HC58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC24A3Q9HC58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC24A3Q9HC58 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC24A3Q9HC58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC24A3Q9HC58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC24A3Q9HC58 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC24A3Q9HC58 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC24A3Q9HC58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC24A3Q9HC58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC24A3Q9HC58 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC24A3Q9HC58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC24A3Q9HC58 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC24A3Q9HC58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC24A3Q9HC58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC24A3Q9HC58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC24A3Q9HC58 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC24A3Q9HC58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC24A3Q9HC58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms