Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RASSF4Q9H2L5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RASSF4Q9H2L5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RASSF4Q9H2L5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RASSF4Q9H2L5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RASSF4Q9H2L5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RASSF4Q9H2L5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RASSF4Q9H2L5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RASSF4Q9H2L5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF4Q9H2L5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF4Q9H2L5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RASSF4Q9H2L5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RASSF4Q9H2L5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASSF4Q9H2L5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RASSF4Q9H2L5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RASSF4Q9H2L5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RASSF4Q9H2L5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RASSF4Q9H2L5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RASSF4Q9H2L5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RASSF4Q9H2L5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RASSF4Q9H2L5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RASSF4Q9H2L5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RASSF4Q9H2L5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RASSF4Q9H2L5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RASSF4Q9H2L5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RASSF4Q9H2L5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RASSF4Q9H2L5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASSF4Q9H2L5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RASSF4Q9H2L5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RASSF4Q9H2L5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RASSF4Q9H2L5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RASSF4Q9H2L5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RASSF4Q9H2L5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RASSF4Q9H2L5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RASSF4Q9H2L5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RASSF4Q9H2L5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RASSF4Q9H2L5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RASSF4Q9H2L5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RASSF4Q9H2L5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RASSF4Q9H2L5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RASSF4Q9H2L5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RASSF4Q9H2L5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RASSF4Q9H2L5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RASSF4Q9H2L5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RASSF4Q9H2L5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RASSF4Q9H2L5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASSF4Q9H2L5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RASSF4Q9H2L5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RASSF4Q9H2L5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASSF4Q9H2L5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASSF4Q9H2L5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RASSF4Q9H2L5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASSF4Q9H2L5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RASSF4Q9H2L5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASSF4Q9H2L5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RASSF4Q9H2L5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RASSF4Q9H2L5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RASSF4Q9H2L5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RASSF4Q9H2L5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RASSF4Q9H2L5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RASSF4Q9H2L5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RASSF4Q9H2L5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RASSF4Q9H2L5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RASSF4Q9H2L5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RASSF4Q9H2L5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RASSF4Q9H2L5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RASSF4Q9H2L5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RASSF4Q9H2L5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RASSF4Q9H2L5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RASSF4Q9H2L5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RASSF4Q9H2L5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RASSF4Q9H2L5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASSF4Q9H2L5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
RASSF4Q9H2L5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RASSF4Q9H2L5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASSF4Q9H2L5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASSF4Q9H2L5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASSF4Q9H2L5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RASSF4Q9H2L5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RASSF4Q9H2L5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RASSF4Q9H2L5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RASSF4Q9H2L5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASSF4Q9H2L5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASSF4Q9H2L5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RASSF4Q9H2L5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms