Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP3-1Q9BYR8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP3-1Q9BYR8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
KRTAP3-1Q9BYR8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP3-1Q9BYR8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRTAP3-1Q9BYR8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRTAP3-1Q9BYR8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRTAP3-1Q9BYR8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRTAP3-1Q9BYR8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms