Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HPS1Q92902 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HPS1Q92902 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HPS1Q92902 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HPS1Q92902 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HPS1Q92902 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HPS1Q92902 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HPS1Q92902 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS1Q92902 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS1Q92902 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPS1Q92902 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPS1Q92902 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPS1Q92902 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPS1Q92902 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HPS1Q92902 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS1Q92902 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS1Q92902 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS1Q92902 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS1Q92902 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS1Q92902 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS1Q92902 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS1Q92902 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HPS1Q92902 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS1Q92902 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS1Q92902 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS1Q92902 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS1Q92902 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS1Q92902 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS1Q92902 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS1Q92902 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS1Q92902 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS1Q92902 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS1Q92902 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS1Q92902 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS1Q92902 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS1Q92902 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS1Q92902 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS1Q92902 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS1Q92902 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPS1Q92902 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPS1Q92902 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPS1Q92902 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPS1Q92902 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPS1Q92902 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPS1Q92902 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPS1Q92902 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPS1Q92902 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS1Q92902 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS1Q92902 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS1Q92902 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS1Q92902 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS1Q92902 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS1Q92902 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS1Q92902 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS1Q92902 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPS1Q92902 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPS1Q92902 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPS1Q92902 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPS1Q92902 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS1Q92902 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS1Q92902 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS1Q92902 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS1Q92902 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS1Q92902 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS1Q92902 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS1Q92902 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS1Q92902 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS1Q92902 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS1Q92902 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS1Q92902 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS1Q92902 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS1Q92902 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS1Q92902 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS1Q92902 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS1Q92902 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS1Q92902 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS1Q92902 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS1Q92902 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms