Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DEDD2Q8WXF8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DEDD2Q8WXF8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DEDD2Q8WXF8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DEDD2Q8WXF8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DEDD2Q8WXF8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DEDD2Q8WXF8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DEDD2Q8WXF8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEDD2Q8WXF8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DEDD2Q8WXF8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DEDD2Q8WXF8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEDD2Q8WXF8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DEDD2Q8WXF8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEDD2Q8WXF8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DEDD2Q8WXF8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEDD2Q8WXF8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DEDD2Q8WXF8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEDD2Q8WXF8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEDD2Q8WXF8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEDD2Q8WXF8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DEDD2Q8WXF8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DEDD2Q8WXF8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DEDD2Q8WXF8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEDD2Q8WXF8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DEDD2Q8WXF8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DEDD2Q8WXF8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DEDD2Q8WXF8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DEDD2Q8WXF8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DEDD2Q8WXF8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DEDD2Q8WXF8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DEDD2Q8WXF8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEDD2Q8WXF8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DEDD2Q8WXF8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEDD2Q8WXF8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEDD2Q8WXF8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEDD2Q8WXF8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEDD2Q8WXF8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEDD2Q8WXF8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEDD2Q8WXF8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEDD2Q8WXF8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEDD2Q8WXF8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEDD2Q8WXF8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEDD2Q8WXF8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEDD2Q8WXF8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEDD2Q8WXF8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEDD2Q8WXF8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEDD2Q8WXF8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEDD2Q8WXF8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEDD2Q8WXF8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEDD2Q8WXF8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEDD2Q8WXF8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEDD2Q8WXF8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEDD2Q8WXF8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEDD2Q8WXF8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEDD2Q8WXF8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEDD2Q8WXF8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEDD2Q8WXF8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEDD2Q8WXF8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEDD2Q8WXF8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEDD2Q8WXF8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEDD2Q8WXF8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEDD2Q8WXF8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEDD2Q8WXF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEDD2Q8WXF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEDD2Q8WXF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEDD2Q8WXF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEDD2Q8WXF8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEDD2Q8WXF8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEDD2Q8WXF8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEDD2Q8WXF8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEDD2Q8WXF8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEDD2Q8WXF8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEDD2Q8WXF8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEDD2Q8WXF8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEDD2Q8WXF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEDD2Q8WXF8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEDD2Q8WXF8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEDD2Q8WXF8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEDD2Q8WXF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEDD2Q8WXF8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEDD2Q8WXF8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEDD2Q8WXF8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEDD2Q8WXF8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEDD2Q8WXF8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEDD2Q8WXF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEDD2Q8WXF8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEDD2Q8WXF8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEDD2Q8WXF8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEDD2Q8WXF8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DEDD2Q8WXF8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEDD2Q8WXF8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEDD2Q8WXF8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEDD2Q8WXF8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEDD2Q8WXF8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEDD2Q8WXF8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEDD2Q8WXF8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEDD2Q8WXF8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEDD2Q8WXF8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEDD2Q8WXF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEDD2Q8WXF8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms