Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NFKBIBQ15653 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NFKBIBQ15653 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NFKBIBQ15653 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NFKBIBQ15653 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NFKBIBQ15653 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NFKBIBQ15653 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NFKBIBQ15653 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NFKBIBQ15653 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NFKBIBQ15653 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NFKBIBQ15653 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NFKBIBQ15653 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NFKBIBQ15653 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NFKBIBQ15653 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NFKBIBQ15653 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NFKBIBQ15653 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NFKBIBQ15653 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NFKBIBQ15653 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
NFKBIBQ15653 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NFKBIBQ15653 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
NFKBIBQ15653 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NFKBIBQ15653 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NFKBIBQ15653 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NFKBIBQ15653 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NFKBIBQ15653 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NFKBIBQ15653 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NFKBIBQ15653 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NFKBIBQ15653 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NFKBIBQ15653 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NFKBIBQ15653 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NFKBIBQ15653 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NFKBIBQ15653 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NFKBIBQ15653 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NFKBIBQ15653 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NFKBIBQ15653 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NFKBIBQ15653 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NFKBIBQ15653 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NFKBIBQ15653 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NFKBIBQ15653 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NFKBIBQ15653 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NFKBIBQ15653 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NFKBIBQ15653 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NFKBIBQ15653 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NFKBIBQ15653 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NFKBIBQ15653 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NFKBIBQ15653 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NFKBIBQ15653 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NFKBIBQ15653 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NFKBIBQ15653 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NFKBIBQ15653 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NFKBIBQ15653 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NFKBIBQ15653 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NFKBIBQ15653 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NFKBIBQ15653 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NFKBIBQ15653 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NFKBIBQ15653 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NFKBIBQ15653 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NFKBIBQ15653 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NFKBIBQ15653 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NFKBIBQ15653 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NFKBIBQ15653 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NFKBIBQ15653 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NFKBIBQ15653 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NFKBIBQ15653 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NFKBIBQ15653 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NFKBIBQ15653 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NFKBIBQ15653 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NFKBIBQ15653 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NFKBIBQ15653 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NFKBIBQ15653 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NFKBIBQ15653 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NFKBIBQ15653 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NFKBIBQ15653 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NFKBIBQ15653 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NFKBIBQ15653 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NFKBIBQ15653 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NFKBIBQ15653 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NFKBIBQ15653 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NFKBIBQ15653 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NFKBIBQ15653 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NFKBIBQ15653 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NFKBIBQ15653 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NFKBIBQ15653 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NFKBIBQ15653 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NFKBIBQ15653 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NFKBIBQ15653 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NFKBIBQ15653 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NFKBIBQ15653 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NFKBIBQ15653 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NFKBIBQ15653 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NFKBIBQ15653 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NFKBIBQ15653 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NFKBIBQ15653 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NFKBIBQ15653 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NFKBIBQ15653 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NFKBIBQ15653 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NFKBIBQ15653 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NFKBIBQ15653 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NFKBIBQ15653 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NFKBIBQ15653 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms