Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
APOFQ13790 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APOFQ13790 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
APOFQ13790 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APOFQ13790 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
APOFQ13790 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
APOFQ13790 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOFQ13790 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOFQ13790 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOFQ13790 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOFQ13790 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOFQ13790 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APOFQ13790 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOFQ13790 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOFQ13790 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOFQ13790 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
APOFQ13790 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOFQ13790 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOFQ13790 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOFQ13790 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOFQ13790 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOFQ13790 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOFQ13790 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOFQ13790 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOFQ13790 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOFQ13790 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOFQ13790 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOFQ13790 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOFQ13790 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOFQ13790 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOFQ13790 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOFQ13790 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOFQ13790 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOFQ13790 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOFQ13790 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOFQ13790 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOFQ13790 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOFQ13790 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOFQ13790 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOFQ13790 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOFQ13790 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOFQ13790 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOFQ13790 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOFQ13790 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APOFQ13790 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOFQ13790 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOFQ13790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOFQ13790 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOFQ13790 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOFQ13790 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOFQ13790 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOFQ13790 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOFQ13790 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOFQ13790 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOFQ13790 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOFQ13790 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOFQ13790 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOFQ13790 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOFQ13790 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOFQ13790 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOFQ13790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOFQ13790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOFQ13790 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOFQ13790 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOFQ13790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOFQ13790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOFQ13790 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOFQ13790 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
APOFQ13790 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOFQ13790 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOFQ13790 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOFQ13790 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOFQ13790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOFQ13790 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOFQ13790 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOFQ13790 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOFQ13790 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
APOFQ13790 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOFQ13790 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOFQ13790 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOFQ13790 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOFQ13790 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOFQ13790 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOFQ13790 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOFQ13790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOFQ13790 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOFQ13790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOFQ13790 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOFQ13790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOFQ13790 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOFQ13790 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOFQ13790 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOFQ13790 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOFQ13790 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOFQ13790 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOFQ13790 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOFQ13790 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOFQ13790 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOFQ13790 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOFQ13790 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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