Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LSAMPQ13449 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LSAMPQ13449 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LSAMPQ13449 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LSAMPQ13449 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LSAMPQ13449 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LSAMPQ13449 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LSAMPQ13449 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LSAMPQ13449 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LSAMPQ13449 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LSAMPQ13449 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LSAMPQ13449 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LSAMPQ13449 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LSAMPQ13449 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LSAMPQ13449 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSAMPQ13449 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LSAMPQ13449 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LSAMPQ13449 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSAMPQ13449 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LSAMPQ13449 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LSAMPQ13449 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LSAMPQ13449 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LSAMPQ13449 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSAMPQ13449 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LSAMPQ13449 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSAMPQ13449 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSAMPQ13449 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSAMPQ13449 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSAMPQ13449 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSAMPQ13449 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSAMPQ13449 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSAMPQ13449 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSAMPQ13449 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LSAMPQ13449 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LSAMPQ13449 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LSAMPQ13449 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LSAMPQ13449 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSAMPQ13449 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LSAMPQ13449 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSAMPQ13449 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSAMPQ13449 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSAMPQ13449 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSAMPQ13449 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSAMPQ13449 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSAMPQ13449 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LSAMPQ13449 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LSAMPQ13449 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSAMPQ13449 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LSAMPQ13449 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LSAMPQ13449 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LSAMPQ13449 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSAMPQ13449 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSAMPQ13449 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSAMPQ13449 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSAMPQ13449 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSAMPQ13449 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LSAMPQ13449 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSAMPQ13449 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSAMPQ13449 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LSAMPQ13449 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSAMPQ13449 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LSAMPQ13449 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSAMPQ13449 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSAMPQ13449 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSAMPQ13449 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSAMPQ13449 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSAMPQ13449 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSAMPQ13449 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LSAMPQ13449 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LSAMPQ13449 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSAMPQ13449 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LSAMPQ13449 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LSAMPQ13449 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSAMPQ13449 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSAMPQ13449 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSAMPQ13449 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSAMPQ13449 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSAMPQ13449 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LSAMPQ13449 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LSAMPQ13449 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSAMPQ13449 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSAMPQ13449 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSAMPQ13449 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSAMPQ13449 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LSAMPQ13449 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LSAMPQ13449 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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