Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL6P80162 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL6P80162 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL6P80162 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL6P80162 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL6P80162 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL6P80162 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL6P80162 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL6P80162 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL6P80162 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CXCL6P80162 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CXCL6P80162 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL6P80162 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL6P80162 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL6P80162 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL6P80162 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL6P80162 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL6P80162 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL6P80162 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL6P80162 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL6P80162 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL6P80162 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL6P80162 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL6P80162 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL6P80162 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL6P80162 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL6P80162 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL6P80162 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL6P80162 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL6P80162 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CXCL6P80162 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL6P80162 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL6P80162 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL6P80162 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL6P80162 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL6P80162 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL6P80162 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL6P80162 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL6P80162 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL6P80162 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL6P80162 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL6P80162 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL6P80162 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL6P80162 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CXCL6P80162 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CXCL6P80162 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL6P80162 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL6P80162 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL6P80162 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL6P80162 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL6P80162 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL6P80162 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL6P80162 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL6P80162 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL6P80162 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL6P80162 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL6P80162 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL6P80162 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXCL6P80162 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL6P80162 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL6P80162 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL6P80162 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL6P80162 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL6P80162 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL6P80162 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL6P80162 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL6P80162 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL6P80162 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL6P80162 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL6P80162 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL6P80162 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL6P80162 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL6P80162 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL6P80162 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL6P80162 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CXCL6P80162 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL6P80162 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms