Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARPC4P59998 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARPC4P59998 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARPC4P59998 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARPC4P59998 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARPC4P59998 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARPC4P59998 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARPC4P59998 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARPC4P59998 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARPC4P59998 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARPC4P59998 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ARPC4P59998 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARPC4P59998 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARPC4P59998 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARPC4P59998 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARPC4P59998 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARPC4P59998 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARPC4P59998 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARPC4P59998 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARPC4P59998 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARPC4P59998 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARPC4P59998 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARPC4P59998 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARPC4P59998 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARPC4P59998 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARPC4P59998 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARPC4P59998 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARPC4P59998 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARPC4P59998 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARPC4P59998 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARPC4P59998 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARPC4P59998 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARPC4P59998 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARPC4P59998 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARPC4P59998 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARPC4P59998 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARPC4P59998 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARPC4P59998 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARPC4P59998 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARPC4P59998 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARPC4P59998 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARPC4P59998 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARPC4P59998 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARPC4P59998 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARPC4P59998 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARPC4P59998 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARPC4P59998 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARPC4P59998 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARPC4P59998 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARPC4P59998 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARPC4P59998 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARPC4P59998 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARPC4P59998 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARPC4P59998 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARPC4P59998 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARPC4P59998 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARPC4P59998 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARPC4P59998 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARPC4P59998 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARPC4P59998 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARPC4P59998 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARPC4P59998 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARPC4P59998 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARPC4P59998 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARPC4P59998 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARPC4P59998 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARPC4P59998 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARPC4P59998 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARPC4P59998 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARPC4P59998 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARPC4P59998 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARPC4P59998 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARPC4P59998 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARPC4P59998 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARPC4P59998 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARPC4P59998 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARPC4P59998 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARPC4P59998 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARPC4P59998 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARPC4P59998 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARPC4P59998 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARPC4P59998 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARPC4P59998 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARPC4P59998 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms