Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP12-1P59990 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP12-1P59990 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP12-1P59990 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP12-1P59990 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP12-1P59990 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP12-1P59990 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP12-1P59990 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP12-1P59990 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP12-1P59990 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP12-1P59990 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP12-1P59990 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP12-1P59990 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP12-1P59990 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP12-1P59990 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP12-1P59990 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP12-1P59990 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP12-1P59990 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP12-1P59990 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KRTAP12-1P59990 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP12-1P59990 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP12-1P59990 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP12-1P59990 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP12-1P59990 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP12-1P59990 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP12-1P59990 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP12-1P59990 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP12-1P59990 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP12-1P59990 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP12-1P59990 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP12-1P59990 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP12-1P59990 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP12-1P59990 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP12-1P59990 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP12-1P59990 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP12-1P59990 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP12-1P59990 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP12-1P59990 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP12-1P59990 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP12-1P59990 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP12-1P59990 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP12-1P59990 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP12-1P59990 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP12-1P59990 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP12-1P59990 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP12-1P59990 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP12-1P59990 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP12-1P59990 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP12-1P59990 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP12-1P59990 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP12-1P59990 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP12-1P59990 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP12-1P59990 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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KRTAP12-1P59990 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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KRTAP12-1P59990 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP12-1P59990 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP12-1P59990 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP12-1P59990 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP12-1P59990 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP12-1P59990 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP12-1P59990 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP12-1P59990 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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