Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GYS2P54840 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
GYS2P54840 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GYS2P54840 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GYS2P54840 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GYS2P54840 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GYS2P54840 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GYS2P54840 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GYS2P54840 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GYS2P54840 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GYS2P54840 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GYS2P54840 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GYS2P54840 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GYS2P54840 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GYS2P54840 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GYS2P54840 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GYS2P54840 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GYS2P54840 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GYS2P54840 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GYS2P54840 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GYS2P54840 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GYS2P54840 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GYS2P54840 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GYS2P54840 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GYS2P54840 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GYS2P54840 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GYS2P54840 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GYS2P54840 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GYS2P54840 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GYS2P54840 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GYS2P54840 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GYS2P54840 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GYS2P54840 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GYS2P54840 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GYS2P54840 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GYS2P54840 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GYS2P54840 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GYS2P54840 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GYS2P54840 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GYS2P54840 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GYS2P54840 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GYS2P54840 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GYS2P54840 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GYS2P54840 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GYS2P54840 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GYS2P54840 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GYS2P54840 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GYS2P54840 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GYS2P54840 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GYS2P54840 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GYS2P54840 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GYS2P54840 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GYS2P54840 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GYS2P54840 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GYS2P54840 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GYS2P54840 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GYS2P54840 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GYS2P54840 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GYS2P54840 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GYS2P54840 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GYS2P54840 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GYS2P54840 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GYS2P54840 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GYS2P54840 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GYS2P54840 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GYS2P54840 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GYS2P54840 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GYS2P54840 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GYS2P54840 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GYS2P54840 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GYS2P54840 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GYS2P54840 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GYS2P54840 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GYS2P54840 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GYS2P54840 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GYS2P54840 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GYS2P54840 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GYS2P54840 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GYS2P54840 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GYS2P54840 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GYS2P54840 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GYS2P54840 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GYS2P54840 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GYS2P54840 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GYS2P54840 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GYS2P54840 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GYS2P54840 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GYS2P54840 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GYS2P54840 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GYS2P54840 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GYS2P54840 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GYS2P54840 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GYS2P54840 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GYS2P54840 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GYS2P54840 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GYS2P54840 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GYS2P54840 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GYS2P54840 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GYS2P54840 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GYS2P54840 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms