Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HRCP23327 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HRCP23327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HRCP23327 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HRCP23327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HRCP23327 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
HRCP23327 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
HRCP23327 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HRCP23327 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
HRCP23327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HRCP23327 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
HRCP23327 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
HRCP23327 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
HRCP23327 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
HRCP23327 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HRCP23327 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
HRCP23327 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
HRCP23327 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
HRCP23327 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
HRCP23327 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HRCP23327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC42.82■■■■■ 4.44
HRCP23327 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
HRCP23327 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HRCP23327 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
HRCP23327 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HRCP23327 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HRCP23327 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
HRCP23327 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
HRCP23327 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
HRCP23327 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
HRCP23327 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
HRCP23327 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
HRCP23327 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
HRCP23327 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
HRCP23327 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
HRCP23327 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
HRCP23327 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
HRCP23327 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
HRCP23327 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
HRCP23327 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
HRCP23327 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
HRCP23327 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
HRCP23327 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
HRCP23327 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
HRCP23327 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
HRCP23327 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
HRCP23327 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HRCP23327 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HRCP23327 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
HRCP23327 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HRCP23327 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HRCP23327 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
HRCP23327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
HRCP23327 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HRCP23327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HRCP23327 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
HRCP23327 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HRCP23327 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HRCP23327 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HRCP23327 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
HRCP23327 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HRCP23327 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HRCP23327 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
HRCP23327 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HRCP23327 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HRCP23327 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HRCP23327 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
HRCP23327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
HRCP23327 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HRCP23327 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
HRCP23327 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
HRCP23327 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
HRCP23327 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
HRCP23327 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HRCP23327 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HRCP23327 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
HRCP23327 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HRCP23327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HRCP23327 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HRCP23327 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
HRCP23327 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HRCP23327 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
HRCP23327 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
HRCP23327 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
HRCP23327 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
HRCP23327 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HRCP23327 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
HRCP23327 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
HRCP23327 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
HRCP23327 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
HRCP23327 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HRCP23327 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HRCP23327 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
HRCP23327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
HRCP23327 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HRCP23327 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
HRCP23327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HRCP23327 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HRCP23327 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HRCP23327 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms