Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC52.41■■■■■ 5.98
HRCP23327 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.99■■■■■ 5.75
HRCP23327 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.97■■■■■ 5.75
HRCP23327 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC50.86■■■■■ 5.73
HRCP23327 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
HRCP23327 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
HRCP23327 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
HRCP23327 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
HRCP23327 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
HRCP23327 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
HRCP23327 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
HRCP23327 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
HRCP23327 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
HRCP23327 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
HRCP23327 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.06■■■■■ 5.44
HRCP23327 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
HRCP23327 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.98■■■■■ 5.43
HRCP23327 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
HRCP23327 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.62■■■■■ 5.37
HRCP23327 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
HRCP23327 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
HRCP23327 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
HRCP23327 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
HRCP23327 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
HRCP23327 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
HRCP23327 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
HRCP23327 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
HRCP23327 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
HRCP23327 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
HRCP23327 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
HRCP23327 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
HRCP23327 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
HRCP23327 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
HRCP23327 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
HRCP23327 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
HRCP23327 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HRCP23327 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
HRCP23327 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
HRCP23327 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
HRCP23327 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.88■■■■■ 5.1
HRCP23327 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
HRCP23327 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
HRCP23327 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
HRCP23327 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
HRCP23327 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
HRCP23327 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
HRCP23327 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
HRCP23327 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
HRCP23327 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
HRCP23327 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
HRCP23327 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
HRCP23327 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
HRCP23327 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC46.13■■■■■ 4.98
HRCP23327 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
HRCP23327 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
HRCP23327 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
HRCP23327 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
HRCP23327 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
HRCP23327 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
HRCP23327 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
HRCP23327 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
HRCP23327 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
HRCP23327 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
HRCP23327 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
HRCP23327 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
HRCP23327 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
HRCP23327 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
HRCP23327 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
HRCP23327 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
HRCP23327 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
HRCP23327 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HRCP23327 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HRCP23327 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HRCP23327 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
HRCP23327 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
HRCP23327 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
HRCP23327 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HRCP23327 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HRCP23327 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
HRCP23327 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
HRCP23327 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
HRCP23327 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
HRCP23327 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
HRCP23327 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
HRCP23327 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
HRCP23327 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
HRCP23327 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
HRCP23327 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
HRCP23327 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
HRCP23327 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
HRCP23327 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
HRCP23327 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
HRCP23327 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
HRCP23327 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
HRCP23327 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
HRCP23327 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
HRCP23327 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
HRCP23327 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
HRCP23327 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
HRCP23327 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms