Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
HRCP23327 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
HRCP23327 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
HRCP23327 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
HRCP23327 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
HRCP23327 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
HRCP23327 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
HRCP23327 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
HRCP23327 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
HRCP23327 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
HRCP23327 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
HRCP23327 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
HRCP23327 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.65■■■■■ 4.74
HRCP23327 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
HRCP23327 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
HRCP23327 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
HRCP23327 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
HRCP23327 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
HRCP23327 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
HRCP23327 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
HRCP23327 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
HRCP23327 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
HRCP23327 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
HRCP23327 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
HRCP23327 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
HRCP23327 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
HRCP23327 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
HRCP23327 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
HRCP23327 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
HRCP23327 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
HRCP23327 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
HRCP23327 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
HRCP23327 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
HRCP23327 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
HRCP23327 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
HRCP23327 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
HRCP23327 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC44.11■■■■■ 4.65
HRCP23327 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
HRCP23327 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
HRCP23327 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
HRCP23327 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
HRCP23327 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
HRCP23327 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HRCP23327 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
HRCP23327 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.95■■■■■ 4.63
HRCP23327 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
HRCP23327 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
HRCP23327 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
HRCP23327 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
HRCP23327 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HRCP23327 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
HRCP23327 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
HRCP23327 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
HRCP23327 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
HRCP23327 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
HRCP23327 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.82■■■■■ 4.61
HRCP23327 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
HRCP23327 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
HRCP23327 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
HRCP23327 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
HRCP23327 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
HRCP23327 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
HRCP23327 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
HRCP23327 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
HRCP23327 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
HRCP23327 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
HRCP23327 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
HRCP23327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
HRCP23327 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
HRCP23327 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HRCP23327 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
HRCP23327 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
HRCP23327 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
HRCP23327 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
HRCP23327 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
HRCP23327 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HRCP23327 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
HRCP23327 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HRCP23327 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
HRCP23327 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
HRCP23327 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
HRCP23327 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
HRCP23327 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
HRCP23327 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
HRCP23327 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
HRCP23327 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
HRCP23327 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
HRCP23327 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
HRCP23327 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
HRCP23327 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
HRCP23327 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
HRCP23327 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
HRCP23327 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
HRCP23327 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HRCP23327 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HRCP23327 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
HRCP23327 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
HRCP23327 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
HRCP23327 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HRCP23327 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms