Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB5AP20339 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB5AP20339 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB5AP20339 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB5AP20339 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB5AP20339 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB5AP20339 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB5AP20339 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB5AP20339 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB5AP20339 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB5AP20339 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB5AP20339 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB5AP20339 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB5AP20339 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB5AP20339 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB5AP20339 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB5AP20339 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB5AP20339 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB5AP20339 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB5AP20339 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB5AP20339 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB5AP20339 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB5AP20339 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB5AP20339 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB5AP20339 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB5AP20339 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB5AP20339 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB5AP20339 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB5AP20339 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB5AP20339 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB5AP20339 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB5AP20339 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB5AP20339 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB5AP20339 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB5AP20339 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB5AP20339 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB5AP20339 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB5AP20339 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB5AP20339 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB5AP20339 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB5AP20339 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB5AP20339 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB5AP20339 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB5AP20339 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB5AP20339 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB5AP20339 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB5AP20339 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB5AP20339 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB5AP20339 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB5AP20339 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB5AP20339 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB5AP20339 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB5AP20339 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB5AP20339 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB5AP20339 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB5AP20339 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB5AP20339 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB5AP20339 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB5AP20339 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB5AP20339 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB5AP20339 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB5AP20339 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB5AP20339 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB5AP20339 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB5AP20339 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB5AP20339 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB5AP20339 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB5AP20339 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB5AP20339 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB5AP20339 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB5AP20339 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB5AP20339 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB5AP20339 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB5AP20339 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB5AP20339 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB5AP20339 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB5AP20339 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB5AP20339 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB5AP20339 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms