Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPNP16150 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPNP16150 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPNP16150 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPNP16150 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPNP16150 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPNP16150 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPNP16150 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPNP16150 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPNP16150 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPNP16150 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPNP16150 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPNP16150 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPNP16150 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPNP16150 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPNP16150 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPNP16150 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPNP16150 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPNP16150 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPNP16150 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPNP16150 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPNP16150 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPNP16150 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPNP16150 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPNP16150 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPNP16150 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPNP16150 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPNP16150 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPNP16150 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPNP16150 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPNP16150 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPNP16150 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPNP16150 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPNP16150 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPNP16150 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPNP16150 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPNP16150 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPNP16150 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPNP16150 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPNP16150 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPNP16150 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPNP16150 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPNP16150 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPNP16150 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPNP16150 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPNP16150 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPNP16150 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPNP16150 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPNP16150 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPNP16150 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPNP16150 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPNP16150 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPNP16150 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPNP16150 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPNP16150 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPNP16150 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPNP16150 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPNP16150 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPNP16150 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPNP16150 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPNP16150 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPNP16150 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPNP16150 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPNP16150 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPNP16150 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPNP16150 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPNP16150 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPNP16150 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPNP16150 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPNP16150 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPNP16150 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPNP16150 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPNP16150 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPNP16150 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPNP16150 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPNP16150 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPNP16150 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPNP16150 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPNP16150 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPNP16150 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPNP16150 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPNP16150 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPNP16150 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPNP16150 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPNP16150 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPNP16150 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPNP16150 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPNP16150 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNP16150 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNP16150 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNP16150 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPNP16150 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNP16150 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNP16150 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNP16150 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNP16150 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNP16150 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNP16150 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPNP16150 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPNP16150 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms