Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRP9O43818 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RRP9O43818 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RRP9O43818 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RRP9O43818 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RRP9O43818 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRP9O43818 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP9O43818 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRP9O43818 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RRP9O43818 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRP9O43818 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRP9O43818 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RRP9O43818 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRP9O43818 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP9O43818 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRP9O43818 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP9O43818 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRP9O43818 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP9O43818 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRP9O43818 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRP9O43818 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP9O43818 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP9O43818 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP9O43818 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP9O43818 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP9O43818 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP9O43818 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRP9O43818 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RRP9O43818 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP9O43818 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP9O43818 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP9O43818 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP9O43818 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP9O43818 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP9O43818 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP9O43818 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP9O43818 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP9O43818 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP9O43818 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP9O43818 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP9O43818 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP9O43818 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP9O43818 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RRP9O43818 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP9O43818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RRP9O43818 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP9O43818 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP9O43818 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP9O43818 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP9O43818 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP9O43818 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP9O43818 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP9O43818 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP9O43818 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP9O43818 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP9O43818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRP9O43818 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP9O43818 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP9O43818 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRP9O43818 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRP9O43818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRP9O43818 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP9O43818 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRP9O43818 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRP9O43818 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RRP9O43818 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRP9O43818 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP9O43818 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RRP9O43818 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP9O43818 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RRP9O43818 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP9O43818 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP9O43818 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP9O43818 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRP9O43818 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP9O43818 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRP9O43818 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP9O43818 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRP9O43818 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRP9O43818 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRP9O43818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP9O43818 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP9O43818 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP9O43818 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RRP9O43818 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RRP9O43818 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP9O43818 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP9O43818 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP9O43818 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP9O43818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRP9O43818 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRP9O43818 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRP9O43818 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP9O43818 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP9O43818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP9O43818 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP9O43818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRP9O43818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRP9O43818 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RRP9O43818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms