Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LP55

UQCRHL, Cytochrome b-c1 complex subunit 6-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRHLA0A096LP55 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
UQCRHLA0A096LP55 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
UQCRHLA0A096LP55 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
UQCRHLA0A096LP55 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
UQCRHLA0A096LP55 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
UQCRHLA0A096LP55 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
UQCRHLA0A096LP55 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
UQCRHLA0A096LP55 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
UQCRHLA0A096LP55 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
UQCRHLA0A096LP55 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
UQCRHLA0A096LP55 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
UQCRHLA0A096LP55 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
UQCRHLA0A096LP55 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
UQCRHLA0A096LP55 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
UQCRHLA0A096LP55 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
UQCRHLA0A096LP55 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
UQCRHLA0A096LP55 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
UQCRHLA0A096LP55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
UQCRHLA0A096LP55 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
UQCRHLA0A096LP55 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UQCRHLA0A096LP55 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UQCRHLA0A096LP55 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UQCRHLA0A096LP55 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UQCRHLA0A096LP55 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UQCRHLA0A096LP55 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UQCRHLA0A096LP55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UQCRHLA0A096LP55 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UQCRHLA0A096LP55 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UQCRHLA0A096LP55 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
UQCRHLA0A096LP55 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UQCRHLA0A096LP55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UQCRHLA0A096LP55 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UQCRHLA0A096LP55 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
UQCRHLA0A096LP55 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UQCRHLA0A096LP55 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UQCRHLA0A096LP55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UQCRHLA0A096LP55 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UQCRHLA0A096LP55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UQCRHLA0A096LP55 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UQCRHLA0A096LP55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
UQCRHLA0A096LP55 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UQCRHLA0A096LP55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UQCRHLA0A096LP55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UQCRHLA0A096LP55 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
UQCRHLA0A096LP55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UQCRHLA0A096LP55 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
UQCRHLA0A096LP55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
UQCRHLA0A096LP55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
UQCRHLA0A096LP55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UQCRHLA0A096LP55 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
UQCRHLA0A096LP55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UQCRHLA0A096LP55 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UQCRHLA0A096LP55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
UQCRHLA0A096LP55 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UQCRHLA0A096LP55 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UQCRHLA0A096LP55 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
UQCRHLA0A096LP55 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
UQCRHLA0A096LP55 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UQCRHLA0A096LP55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UQCRHLA0A096LP55 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
UQCRHLA0A096LP55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
UQCRHLA0A096LP55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UQCRHLA0A096LP55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UQCRHLA0A096LP55 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UQCRHLA0A096LP55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UQCRHLA0A096LP55 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UQCRHLA0A096LP55 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UQCRHLA0A096LP55 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
UQCRHLA0A096LP55 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UQCRHLA0A096LP55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UQCRHLA0A096LP55 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
UQCRHLA0A096LP55 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
UQCRHLA0A096LP55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
UQCRHLA0A096LP55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UQCRHLA0A096LP55 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UQCRHLA0A096LP55 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UQCRHLA0A096LP55 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UQCRHLA0A096LP55 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
UQCRHLA0A096LP55 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UQCRHLA0A096LP55 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UQCRHLA0A096LP55 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
UQCRHLA0A096LP55 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UQCRHLA0A096LP55 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UQCRHLA0A096LP55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UQCRHLA0A096LP55 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UQCRHLA0A096LP55 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UQCRHLA0A096LP55 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UQCRHLA0A096LP55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UQCRHLA0A096LP55 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UQCRHLA0A096LP55 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UQCRHLA0A096LP55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UQCRHLA0A096LP55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
UQCRHLA0A096LP55 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UQCRHLA0A096LP55 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
UQCRHLA0A096LP55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UQCRHLA0A096LP55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
UQCRHLA0A096LP55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
UQCRHLA0A096LP55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
UQCRHLA0A096LP55 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UQCRHLA0A096LP55 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms