Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MKKSQ9NPJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKKSQ9NPJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKKSQ9NPJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKKSQ9NPJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKKSQ9NPJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms