Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX25Q9H3E2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX25Q9H3E2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX25Q9H3E2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX25Q9H3E2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX25Q9H3E2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX25Q9H3E2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms