RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302945.2

GSX1-201, Transcript of GS homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSX1, Length 1,663 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX1-201ENST00000302945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.99■■■■■ 6.87
GSX1-201ENST00000302945 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.75■■■■■ 5.72
GSX1-201ENST00000302945 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
GSX1-201ENST00000302945 ABCC9O60706 1549 aa48.09■■■■■ 5.29
GSX1-201ENST00000302945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.01■■■■■ 5.28
GSX1-201ENST00000302945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.96■■■■■ 5.27
GSX1-201ENST00000302945 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.56■■■■■ 5.2
GSX1-201ENST00000302945 NACADO15069 1562 aa47.33■■■■■ 5.17
GSX1-201ENST00000302945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
GSX1-201ENST00000302945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
GSX1-201ENST00000302945 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
GSX1-201ENST00000302945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.97■■■■■ 4.95
GSX1-201ENST00000302945 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.47■■■■■ 4.87
GSX1-201ENST00000302945 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.3■■■■■ 4.84
GSX1-201ENST00000302945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
GSX1-201ENST00000302945 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.01■■■■■ 4.8
GSX1-201ENST00000302945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
GSX1-201ENST00000302945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
GSX1-201ENST00000302945 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.74■■■■■ 4.75
GSX1-201ENST00000302945 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.74
GSX1-201ENST00000302945 WIZO95785 1651 aa44.38■■■■■ 4.7
GSX1-201ENST00000302945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
GSX1-201ENST00000302945 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.12■■■■■ 4.65
GSX1-201ENST00000302945 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.95■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
GSX1-201ENST00000302945 NCAPD3P42695 1498 aa43.66■■■■■ 4.58
GSX1-201ENST00000302945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.6■■■■■ 4.57
GSX1-201ENST00000302945 HMGXB3Q12766 1538 aa43.57■■■■■ 4.57
GSX1-201ENST00000302945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.56■■■■■ 4.56
GSX1-201ENST00000302945 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.48■■■■■ 4.55
GSX1-201ENST00000302945 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.14■■■■■ 4.5
GSX1-201ENST00000302945 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
GSX1-201ENST00000302945 TRIM41Q8WV44 630 aa42.57■■■■■ 4.41
GSX1-201ENST00000302945 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.52■■■■■ 4.4
GSX1-201ENST00000302945 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
GSX1-201ENST00000302945 ABCC8Q09428 1581 aa42.43■■■■■ 4.38
GSX1-201ENST00000302945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.27■■■■■ 4.36
GSX1-201ENST00000302945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
GSX1-201ENST00000302945 NESP48681 1621 aa42.12■■■■■ 4.33
GSX1-201ENST00000302945 SYNJ1O43426 1573 aa42.04■■■■■ 4.32
GSX1-201ENST00000302945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.02■■■■■ 4.32
GSX1-201ENST00000302945 TOP2BQ02880 1626 aa41.96■■■■■ 4.31
GSX1-201ENST00000302945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.93■■■■■ 4.3
GSX1-201ENST00000302945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.93■■■■■ 4.3
GSX1-201ENST00000302945 CUX1P39880 1505 aa41.86■■■■■ 4.29
GSX1-201ENST00000302945 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.8■■■■■ 4.28
GSX1-201ENST00000302945 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
GSX1-201ENST00000302945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.67■■■■■ 4.26
GSX1-201ENST00000302945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.62■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 EEA1Q15075 1411 aa41.61■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 SOGA1O94964 1423 aa41.59■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 TOPBP1Q92547 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
GSX1-201ENST00000302945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
GSX1-201ENST00000302945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
GSX1-201ENST00000302945 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.43■■■■■ 4.22
GSX1-201ENST00000302945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.43■■■■■ 4.22
GSX1-201ENST00000302945 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.37■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.36■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 ERCC6Q03468 1493 aa41.33■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
GSX1-201ENST00000302945 KIF27Q86VH2 1401 aa41.26■■■■■ 4.2
GSX1-201ENST00000302945 CUX2O14529 1486 aa41.15■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 WDR62O43379 1518 aa41.14■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.14■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
GSX1-201ENST00000302945 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.05■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 KIF21BO75037 1637 aa41.02■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 WDR97A6NE52 1622 aa40.99■■■■■ 4.15
GSX1-201ENST00000302945 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
GSX1-201ENST00000302945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
GSX1-201ENST00000302945 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
GSX1-201ENST00000302945 PRXQ9BXM0 1461 aa40.87■■■■■ 4.13
GSX1-201ENST00000302945 IFT140Q96RY7 1462 aa40.84■■■■■ 4.13
GSX1-201ENST00000302945 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.81■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.8■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.79■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.77■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.74■■■■■ 4.11
GSX1-201ENST00000302945 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.69■■■■■ 4.1
GSX1-201ENST00000302945 CUL7Q14999 1698 aa40.64■■■■■ 4.1
GSX1-201ENST00000302945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.08
GSX1-201ENST00000302945 PBRM1Q86U86 1689 aa40.54■■■■■ 4.08
GSX1-201ENST00000302945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
GSX1-201ENST00000302945 CEP162Q5TB80 1403 aa40.5■■■■■ 4.07
GSX1-201ENST00000302945 GRIN2BQ13224 1484 aa40.48■■■■■ 4.07
GSX1-201ENST00000302945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
GSX1-201ENST00000302945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.32■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 CLIP1P30622 1438 aa40.28■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.18■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.14■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
GSX1-201ENST00000302945 SYNJ2O15056 1496 aa40.01■■■■□ 3.99
GSX1-201ENST00000302945 GRIN2AQ12879 1464 aa39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms