RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371095.7

GNAS-211, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNAS, Length 1,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-211ENST00000371095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.5■■■■■ 6.79
GNAS-211ENST00000371095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.99■■■■■ 5.59
GNAS-211ENST00000371095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
GNAS-211ENST00000371095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.53■■■■■ 5.2
GNAS-211ENST00000371095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.5■■■■■ 5.19
GNAS-211ENST00000371095 ABCC9O60706 1549 aa47.21■■■■■ 5.15
GNAS-211ENST00000371095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.12■■■■■ 5.13
GNAS-211ENST00000371095 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.86■■■■■ 5.09
GNAS-211ENST00000371095 NACADO15069 1562 aa46.54■■■■■ 5.04
GNAS-211ENST00000371095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.11■■■■■ 4.97
GNAS-211ENST00000371095 SCRIBQ14160 1630 aa46.07■■■■■ 4.97
GNAS-211ENST00000371095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
GNAS-211ENST00000371095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.2■■■■■ 4.83
GNAS-211ENST00000371095 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.74■■■■■ 4.75
GNAS-211ENST00000371095 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.7■■■■■ 4.75
GNAS-211ENST00000371095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
GNAS-211ENST00000371095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.731e-59■■□□□ 11.4
GNAS-211ENST00000371095 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.45■■■■■ 4.71
GNAS-211ENST00000371095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
GNAS-211ENST00000371095 SMARCA4P51532 1647 aa44.15■■■■■ 4.66
GNAS-211ENST00000371095 WIZO95785 1651 aa44.09■■■■■ 4.65
GNAS-211ENST00000371095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
GNAS-211ENST00000371095 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
GNAS-211ENST00000371095 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.56■■■■■ 4.56
GNAS-211ENST00000371095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.4■■■■■ 4.54
GNAS-211ENST00000371095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
GNAS-211ENST00000371095 SMARCA2P51531 1590 aa43.36■■■■■ 4.53
GNAS-211ENST00000371095 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.21■■■■■ 4.51
GNAS-211ENST00000371095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
GNAS-211ENST00000371095 NCAPD3P42695 1498 aa42.98■■■■■ 4.47
GNAS-211ENST00000371095 HMGXB3Q12766 1538 aa42.92■■■■■ 4.46
GNAS-211ENST00000371095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.7■■■■■ 4.43
GNAS-211ENST00000371095 TRIM41Q8WV44 630 aa42.68■■■■■ 4.42
GNAS-211ENST00000371095 ABCC8Q09428 1581 aa42.37■■■■■ 4.37
GNAS-211ENST00000371095 CFTRP13569 1480 aa42.09■■■■■ 4.33
GNAS-211ENST00000371095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.334e-6■■□□□ 11.4
GNAS-211ENST00000371095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
GNAS-211ENST00000371095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.94■■■■■ 4.3
GNAS-211ENST00000371095 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.92■■■■■ 4.3
GNAS-211ENST00000371095 SYNJ1O43426 1573 aa41.88■■■■■ 4.29
GNAS-211ENST00000371095 PRDM2Q13029 1718 aa41.83■■■■■ 4.29
GNAS-211ENST00000371095 TOP2BQ02880 1626 aa41.68■■■■■ 4.26
GNAS-211ENST00000371095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.65■■■■■ 4.26
GNAS-211ENST00000371095 SOGA1O94964 1423 aa41.63■■■■■ 4.26
GNAS-211ENST00000371095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.61■■■■■ 4.25
GNAS-211ENST00000371095 CUX1P39880 1505 aa41.55■■■■■ 4.24
GNAS-211ENST00000371095 EEA1Q15075 1411 aa41.52■■■■■ 4.24
GNAS-211ENST00000371095 NESP48681 1621 aa41.51■■■■■ 4.24
GNAS-211ENST00000371095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.47■■■■■ 4.23
GNAS-211ENST00000371095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.46■■■■■ 4.23
GNAS-211ENST00000371095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.46■■■■■ 4.23
GNAS-211ENST00000371095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.38■■■■■ 4.21
GNAS-211ENST00000371095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.34■■■■■ 4.21
GNAS-211ENST00000371095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.17■■■■■ 4.18
GNAS-211ENST00000371095 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.16■■■■■ 4.18
GNAS-211ENST00000371095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.09■■■■■ 4.17
GNAS-211ENST00000371095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.06■■■■■ 4.16
GNAS-211ENST00000371095 TOPBP1Q92547 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
GNAS-211ENST00000371095 GOLGA3Q08378 1498 aa40.98■■■■■ 4.15
GNAS-211ENST00000371095 KIF27Q86VH2 1401 aa40.98■■■■■ 4.15
GNAS-211ENST00000371095 KIF21BO75037 1637 aa40.98■■■■■ 4.15
GNAS-211ENST00000371095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.97■■■■■ 4.15
GNAS-211ENST00000371095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
GNAS-211ENST00000371095 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.9■■■■■ 4.14
GNAS-211ENST00000371095 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
GNAS-211ENST00000371095 CUX2O14529 1486 aa40.84■■■■■ 4.13
GNAS-211ENST00000371095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
GNAS-211ENST00000371095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.76■■■■■ 4.12
GNAS-211ENST00000371095 PRXQ9BXM0 1461 aa40.75■■■■■ 4.11
GNAS-211ENST00000371095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.74■■■■■ 4.11
GNAS-211ENST00000371095 CEP162Q5TB80 1403 aa40.71■■■■■ 4.11
GNAS-211ENST00000371095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.69■■■■■ 4.1
GNAS-211ENST00000371095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.67■■■■■ 4.1
GNAS-211ENST00000371095 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.63■■■■■ 4.09
GNAS-211ENST00000371095 IGF1RP08069 1367 aa40.61■■■■■ 4.09
GNAS-211ENST00000371095 WDR97A6NE52 1622 aa40.51■■■■■ 4.08
GNAS-211ENST00000371095 ERCC6Q03468 1493 aa40.45■■■■■ 4.07
GNAS-211ENST00000371095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.41■■■■■ 4.06
GNAS-211ENST00000371095 WDR62O43379 1518 aa40.4■■■■■ 4.06
GNAS-211ENST00000371095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
GNAS-211ENST00000371095 CLIP1P30622 1438 aa40.36■■■■■ 4.05
GNAS-211ENST00000371095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
GNAS-211ENST00000371095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.33■■■■■ 4.05
GNAS-211ENST00000371095 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.27■■■■■ 4.04
GNAS-211ENST00000371095 CUL7Q14999 1698 aa40.23■■■■■ 4.03
GNAS-211ENST00000371095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
GNAS-211ENST00000371095 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.2■■■■■ 4.03
GNAS-211ENST00000371095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
GNAS-211ENST00000371095 IFT140Q96RY7 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
GNAS-211ENST00000371095 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
GNAS-211ENST00000371095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 46e-9■■■■□ 21.8
GNAS-211ENST00000371095 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.01■■■■■ 4
GNAS-211ENST00000371095 PBRM1Q86U86 1689 aa40■■■■□ 3.99
GNAS-211ENST00000371095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
GNAS-211ENST00000371095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
GNAS-211ENST00000371095 ARAP1Q96P48 1450 aa39.93■■■■□ 3.98
GNAS-211ENST00000371095 GRIN2BQ13224 1484 aa39.92■■■■□ 3.98
GNAS-211ENST00000371095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.89■■■■□ 3.98
GNAS-211ENST00000371095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.82■■■■□ 3.97
GNAS-211ENST00000371095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.81■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms