Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAP1Q03518 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAP1Q03518 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAP1Q03518 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms