RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585206.1

DSG2-202, Transcript of desmoglein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DSG2, Length 1,081 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2-202ENST00000585206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.02■■■■■ 7.2
DSG2-202ENST00000585206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.79■■■■■ 6.2
DSG2-202ENST00000585206 ABCC9O60706 1549 aa53.66■■■■■ 6.18
DSG2-202ENST00000585206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.14■■■■■ 5.78
DSG2-202ENST00000585206 NACADO15069 1562 aa50.81■■■■■ 5.72
DSG2-202ENST00000585206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.62■■■■■ 5.69
DSG2-202ENST00000585206 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.15■■■■■ 5.62
DSG2-202ENST00000585206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.11■■■■■ 5.61
DSG2-202ENST00000585206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.97■■■■■ 5.59
DSG2-202ENST00000585206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.95■■■■■ 5.59
DSG2-202ENST00000585206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
DSG2-202ENST00000585206 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.61■■■■■ 5.53
DSG2-202ENST00000585206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.57■■■■■ 5.53
DSG2-202ENST00000585206 SCRIBQ14160 1630 aa49.07■■■■■ 5.45
DSG2-202ENST00000585206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.99■■■■■ 5.43
DSG2-202ENST00000585206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.46■■■■■ 5.35
DSG2-202ENST00000585206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
DSG2-202ENST00000585206 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.32■■■■■ 5.33
DSG2-202ENST00000585206 NCAPD3P42695 1498 aa46.89■■■■■ 5.1
DSG2-202ENST00000585206 SMARCA4P51532 1647 aa46.8■■■■■ 5.08
DSG2-202ENST00000585206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
DSG2-202ENST00000585206 SMARCA2P51531 1590 aa46.69■■■■■ 5.07
DSG2-202ENST00000585206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.6■■■■■ 5.05
DSG2-202ENST00000585206 HMGXB3Q12766 1538 aa46.59■■■■■ 5.05
DSG2-202ENST00000585206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
DSG2-202ENST00000585206 ERCC6Q03468 1493 aa46.36■■■■■ 5.01
DSG2-202ENST00000585206 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.31■■■■■ 5
DSG2-202ENST00000585206 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.25■■■■■ 4.99
DSG2-202ENST00000585206 CUX2O14529 1486 aa46.18■■■■■ 4.98
DSG2-202ENST00000585206 NESP48681 1621 aa46.13■■■■■ 4.97
DSG2-202ENST00000585206 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.91■■■■■ 4.94
DSG2-202ENST00000585206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.84■■■■■ 4.93
DSG2-202ENST00000585206 WIZO95785 1651 aa45.7■■■■■ 4.91
DSG2-202ENST00000585206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
DSG2-202ENST00000585206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.58■■■■■ 4.89
DSG2-202ENST00000585206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.54■■■■■ 4.88
DSG2-202ENST00000585206 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.49■■■■■ 4.87
DSG2-202ENST00000585206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
DSG2-202ENST00000585206 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.18■■■■■ 4.82
DSG2-202ENST00000585206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
DSG2-202ENST00000585206 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.05■■■■■ 4.8
DSG2-202ENST00000585206 WDR62O43379 1518 aa45.05■■■■■ 4.8
DSG2-202ENST00000585206 CFTRP13569 1480 aa45■■■■■ 4.79
DSG2-202ENST00000585206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.99■■■■■ 4.79
DSG2-202ENST00000585206 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.62■■■■■ 4.73
DSG2-202ENST00000585206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
DSG2-202ENST00000585206 PRDM2Q13029 1718 aa44.58■■■■■ 4.73
DSG2-202ENST00000585206 TOPBP1Q92547 1522 aa44.15■■■■■ 4.66
DSG2-202ENST00000585206 IFT140Q96RY7 1462 aa44.13■■■■■ 4.65
DSG2-202ENST00000585206 OSCARQ8IYS5 282 aa44.08■■■■■ 4.65
DSG2-202ENST00000585206 ABCC8Q09428 1581 aa44.06■■■■■ 4.64
DSG2-202ENST00000585206 TRIM41Q8WV44 630 aa44.04■■■■■ 4.64
DSG2-202ENST00000585206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
DSG2-202ENST00000585206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.02■■■■■ 4.64
DSG2-202ENST00000585206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
DSG2-202ENST00000585206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
DSG2-202ENST00000585206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
DSG2-202ENST00000585206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.64■■■■■ 4.581e-9■■■■■ 27.6
DSG2-202ENST00000585206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.55■■■■■ 4.56
DSG2-202ENST00000585206 SOGA1O94964 1423 aa43.52■■■■■ 4.56
DSG2-202ENST00000585206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.5■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.5■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.5■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.48■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 CUX1P39880 1505 aa43.46■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 CHD1O14646 1710 aa43.45■■■■■ 4.55
DSG2-202ENST00000585206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
DSG2-202ENST00000585206 ARHGEF11O15085 1522 aa43.38■■■■■ 4.54
DSG2-202ENST00000585206 FBLN2P98095 1184 aa43.37■■■■■ 4.53
DSG2-202ENST00000585206 WDR97A6NE52 1622 aa43.33■■■■■ 4.53
DSG2-202ENST00000585206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.25■■■■■ 4.51
DSG2-202ENST00000585206 GRIN2BQ13224 1484 aa43.13■■■■■ 4.5
DSG2-202ENST00000585206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
DSG2-202ENST00000585206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
DSG2-202ENST00000585206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.05■■■■■ 4.48
DSG2-202ENST00000585206 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 PBRM1Q86U86 1689 aa42.98■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.98■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 SYNJ2O15056 1496 aa42.98■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 ARAP1Q96P48 1450 aa42.98■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 SYNJ1O43426 1573 aa42.97■■■■■ 4.47
DSG2-202ENST00000585206 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.94■■■■■ 4.46
DSG2-202ENST00000585206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.91■■■■■ 4.46
DSG2-202ENST00000585206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
DSG2-202ENST00000585206 TOP2BQ02880 1626 aa42.8■■■■■ 4.44
DSG2-202ENST00000585206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.8■■■■■ 4.44
DSG2-202ENST00000585206 ADAMTS12P58397 1594 aa42.6■■■■■ 4.41
DSG2-202ENST00000585206 GRIN2AQ12879 1464 aa42.57■■■■■ 4.41
DSG2-202ENST00000585206 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
DSG2-202ENST00000585206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.47■■■■■ 4.39
DSG2-202ENST00000585206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.45■■■■■ 4.39
DSG2-202ENST00000585206 NUP160Q12769 1436 aa42.42■■■■■ 4.38
DSG2-202ENST00000585206 CEP170Q5SW79 1584 aa42.41■■■■■ 4.38
DSG2-202ENST00000585206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.29■■■■■ 4.36
DSG2-202ENST00000585206 SHROOM2Q13796 1616 aa42.2■■■■■ 4.35
DSG2-202ENST00000585206 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
DSG2-202ENST00000585206 KIF27Q86VH2 1401 aa42■■■■■ 4.31
DSG2-202ENST00000585206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.99■■■■■ 4.31
DSG2-202ENST00000585206 JPH4Q96JJ6 628 aa41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms