RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634842.1

C1orf232-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 230, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene C1orf232, Length 643 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf232-201ENST00000634842 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.22■■■■■ 7.23
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C1orf232-201ENST00000634842 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.95■■■■■ 5.91
C1orf232-201ENST00000634842 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.78■■■■■ 5.88
C1orf232-201ENST00000634842 NACADO15069 1562 aa51.3■■■■■ 5.8
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C1orf232-201ENST00000634842 SCRIBQ14160 1630 aa49.49■■■■■ 5.51
C1orf232-201ENST00000634842 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.45■■■■■ 5.51
C1orf232-201ENST00000634842 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.42■■■■■ 5.5
C1orf232-201ENST00000634842 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.31■■■■■ 5.48
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C1orf232-201ENST00000634842 CUX2O14529 1486 aa47.22■■■■■ 5.15
C1orf232-201ENST00000634842 ERCC6Q03468 1493 aa47.19■■■■■ 5.14
C1orf232-201ENST00000634842 SMARCA4P51532 1647 aa47.11■■■■■ 5.13
C1orf232-201ENST00000634842 NESP48681 1621 aa47.01■■■■■ 5.12
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C1orf232-201ENST00000634842 SMARCA2P51531 1590 aa46.98■■■■■ 5.11
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C1orf232-201ENST00000634842 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.93■■■■■ 4.94
C1orf232-201ENST00000634842 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.79■■■■■ 4.92
C1orf232-201ENST00000634842 WDR62O43379 1518 aa45.72■■■■■ 4.91
C1orf232-201ENST00000634842 TRIM41Q8WV44 630 aa45.59■■■■■ 4.89
C1orf232-201ENST00000634842 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.49■■■■■ 4.87
C1orf232-201ENST00000634842 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.46■■■■■ 4.87
C1orf232-201ENST00000634842 CFTRP13569 1480 aa45.34■■■■■ 4.85
C1orf232-201ENST00000634842 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
C1orf232-201ENST00000634842 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
C1orf232-201ENST00000634842 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
C1orf232-201ENST00000634842 OSCARQ8IYS5 282 aa44.99■■■■■ 4.79
C1orf232-201ENST00000634842 PRDM2Q13029 1718 aa44.91■■■■■ 4.78
C1orf232-201ENST00000634842 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.76
C1orf232-201ENST00000634842 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.75■■■■■ 4.75
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C1orf232-201ENST00000634842 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.63■■■■■ 4.73
C1orf232-201ENST00000634842 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.63■■■■■ 4.73
C1orf232-201ENST00000634842 TOPBP1Q92547 1522 aa44.58■■■■■ 4.73
C1orf232-201ENST00000634842 IFT140Q96RY7 1462 aa44.58■■■■■ 4.73
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C1orf232-201ENST00000634842 CHD1O14646 1710 aa44.25■■■■■ 4.67
C1orf232-201ENST00000634842 ABCC8Q09428 1581 aa44.24■■■■■ 4.67
C1orf232-201ENST00000634842 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.24■■■■■ 4.67
C1orf232-201ENST00000634842 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
C1orf232-201ENST00000634842 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.08■■■■■ 4.65
C1orf232-201ENST00000634842 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.02■■■■■ 4.64
C1orf232-201ENST00000634842 ARAP1Q96P48 1450 aa43.97■■■■■ 4.63
C1orf232-201ENST00000634842 FBLN2P98095 1184 aa43.95■■■■■ 4.63
C1orf232-201ENST00000634842 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
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C1orf232-201ENST00000634842 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
C1orf232-201ENST00000634842 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.73■■■■■ 4.59
C1orf232-201ENST00000634842 CUX1P39880 1505 aa43.69■■■■■ 4.59
C1orf232-201ENST00000634842 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
C1orf232-201ENST00000634842 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.65■■■■■ 4.58
C1orf232-201ENST00000634842 WDR97A6NE52 1622 aa43.55■■■■■ 4.56
C1orf232-201ENST00000634842 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
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C1orf232-201ENST00000634842 SYNJ1O43426 1573 aa43.46■■■■■ 4.55
C1orf232-201ENST00000634842 GRIN2BQ13224 1484 aa43.46■■■■■ 4.55
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C1orf232-201ENST00000634842 SYNJ2O15056 1496 aa43.38■■■■■ 4.54
C1orf232-201ENST00000634842 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.28■■■■■ 4.52
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C1orf232-201ENST00000634842 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.09■■■■■ 4.49
C1orf232-201ENST00000634842 GRIN2AQ12879 1464 aa42.96■■■■■ 4.47
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C1orf232-201ENST00000634842 ADAMTS12P58397 1594 aa42.92■■■■■ 4.46
C1orf232-201ENST00000634842 CEP170Q5SW79 1584 aa42.92■■■■■ 4.46
C1orf232-201ENST00000634842 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.85■■■■■ 4.45
C1orf232-201ENST00000634842 NUP160Q12769 1436 aa42.83■■■■■ 4.45
C1orf232-201ENST00000634842 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.82■■■■■ 4.44
C1orf232-201ENST00000634842 TOP2BQ02880 1626 aa42.79■■■■■ 4.44
C1orf232-201ENST00000634842 SHROOM2Q13796 1616 aa42.75■■■■■ 4.43
C1orf232-201ENST00000634842 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.67■■■■■ 4.42
C1orf232-201ENST00000634842 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
C1orf232-201ENST00000634842 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
C1orf232-201ENST00000634842 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.53■■■■■ 4.4
C1orf232-201ENST00000634842 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
C1orf232-201ENST00000634842 JPH4Q96JJ6 628 aa42.36■■■■■ 4.37
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