Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFS1P28331 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFS1P28331 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFS1P28331 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms