Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NEFMP07197 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NEFMP07197 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NEFMP07197 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NEFMP07197 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEFMP07197 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFMP07197 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFMP07197 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFMP07197 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFMP07197 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFMP07197 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFMP07197 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFMP07197 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFMP07197 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFMP07197 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFMP07197 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFMP07197 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFMP07197 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFMP07197 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFMP07197 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFMP07197 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFMP07197 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFMP07197 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFMP07197 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFMP07197 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFMP07197 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFMP07197 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEFMP07197 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEFMP07197 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEFMP07197 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEFMP07197 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NEFMP07197 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEFMP07197 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEFMP07197 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEFMP07197 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEFMP07197 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFMP07197 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFMP07197 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFMP07197 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NEFMP07197 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NEFMP07197 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFMP07197 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFMP07197 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFMP07197 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEFMP07197 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEFMP07197 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEFMP07197 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NEFMP07197 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFMP07197 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEFMP07197 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEFMP07197 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFMP07197 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEFMP07197 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEFMP07197 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEFMP07197 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFMP07197 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFMP07197 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NEFMP07197 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEFMP07197 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEFMP07197 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEFMP07197 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEFMP07197 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFMP07197 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFMP07197 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFMP07197 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFMP07197 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFMP07197 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NEFMP07197 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEFMP07197 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms