Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNDIG1LA6NDD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNDIG1LA6NDD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms