RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350771.7

H2AFV-204, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene H2AFV, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-204ENST00000350771 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.01■■■■■ 7.68
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H2AFV-204ENST00000350771 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.61■■■■■ 6.01
H2AFV-204ENST00000350771 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.54■■■■■ 6
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H2AFV-204ENST00000350771 SMARCA2P51531 1590 aa48.52■■■■■ 5.36
H2AFV-204ENST00000350771 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.48■■■■■ 5.35
H2AFV-204ENST00000350771 HMGXB3Q12766 1538 aa48.35■■■■■ 5.33
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H2AFV-204ENST00000350771 WIZO95785 1651 aa48■■■■■ 5.27
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H2AFV-204ENST00000350771 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.24■■■■■ 5.15
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H2AFV-204ENST00000350771 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.8■■■■■ 4.92
H2AFV-204ENST00000350771 CUX1P39880 1505 aa45.53■■■■■ 4.88
H2AFV-204ENST00000350771 IFT140Q96RY7 1462 aa45.51■■■■■ 4.88
H2AFV-204ENST00000350771 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
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H2AFV-204ENST00000350771 TOP2BQ02880 1626 aa45.2■■■■■ 4.83
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H2AFV-204ENST00000350771 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
H2AFV-204ENST00000350771 WDR97A6NE52 1622 aa45.07■■■■■ 4.81
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H2AFV-204ENST00000350771 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.96■■■■■ 4.79
H2AFV-204ENST00000350771 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
H2AFV-204ENST00000350771 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.79■■■■■ 4.76
H2AFV-204ENST00000350771 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.72■■■■■ 4.75
H2AFV-204ENST00000350771 GRIN2BQ13224 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
H2AFV-204ENST00000350771 CHD1O14646 1710 aa44.66■■■■■ 4.74
H2AFV-204ENST00000350771 PBRM1Q86U86 1689 aa44.64■■■■■ 4.74
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H2AFV-204ENST00000350771 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.6■■■■■ 4.73
H2AFV-204ENST00000350771 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.6■■■■■ 4.73
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H2AFV-204ENST00000350771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.42■■■■■ 4.7
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H2AFV-204ENST00000350771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.22■■■■■ 4.67
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H2AFV-204ENST00000350771 ARAP1Q96P48 1450 aa44.03■■■■■ 4.64
H2AFV-204ENST00000350771 NUP160Q12769 1436 aa43.99■■■■■ 4.63
H2AFV-204ENST00000350771 CEP170Q5SW79 1584 aa43.92■■■■■ 4.62
H2AFV-204ENST00000350771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.9■■■■■ 4.62
H2AFV-204ENST00000350771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.81■■■■■ 4.6
H2AFV-204ENST00000350771 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.73■■■■■ 4.59
H2AFV-204ENST00000350771 SHROOM2Q13796 1616 aa43.67■■■■■ 4.58
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