Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNDIG1LA6NDD5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYNDIG1LA6NDD5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYNDIG1LA6NDD5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNDIG1LA6NDD5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNDIG1LA6NDD5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNDIG1LA6NDD5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNDIG1LA6NDD5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNDIG1LA6NDD5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNDIG1LA6NDD5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNDIG1LA6NDD5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNDIG1LA6NDD5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNDIG1LA6NDD5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYNDIG1LA6NDD5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNDIG1LA6NDD5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNDIG1LA6NDD5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNDIG1LA6NDD5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNDIG1LA6NDD5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNDIG1LA6NDD5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNDIG1LA6NDD5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNDIG1LA6NDD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNDIG1LA6NDD5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNDIG1LA6NDD5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNDIG1LA6NDD5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNDIG1LA6NDD5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNDIG1LA6NDD5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNDIG1LA6NDD5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNDIG1LA6NDD5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNDIG1LA6NDD5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNDIG1LA6NDD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNDIG1LA6NDD5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNDIG1LA6NDD5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNDIG1LA6NDD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNDIG1LA6NDD5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNDIG1LA6NDD5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNDIG1LA6NDD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNDIG1LA6NDD5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNDIG1LA6NDD5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNDIG1LA6NDD5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNDIG1LA6NDD5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNDIG1LA6NDD5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNDIG1LA6NDD5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNDIG1LA6NDD5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNDIG1LA6NDD5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNDIG1LA6NDD5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNDIG1LA6NDD5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNDIG1LA6NDD5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNDIG1LA6NDD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNDIG1LA6NDD5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNDIG1LA6NDD5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNDIG1LA6NDD5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNDIG1LA6NDD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNDIG1LA6NDD5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNDIG1LA6NDD5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNDIG1LA6NDD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNDIG1LA6NDD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNDIG1LA6NDD5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNDIG1LA6NDD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNDIG1LA6NDD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNDIG1LA6NDD5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNDIG1LA6NDD5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNDIG1LA6NDD5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNDIG1LA6NDD5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNDIG1LA6NDD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNDIG1LA6NDD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNDIG1LA6NDD5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNDIG1LA6NDD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNDIG1LA6NDD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNDIG1LA6NDD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNDIG1LA6NDD5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms