Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOBEC2Q9Y235 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOBEC2Q9Y235 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBEC2Q9Y235 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOBEC2Q9Y235 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC2Q9Y235 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms