Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJC17Q9NVM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJC17Q9NVM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAJC17Q9NVM6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJC17Q9NVM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJC17Q9NVM6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms