Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD27Q96NW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD27Q96NW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD27Q96NW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD27Q96NW4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD27Q96NW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD27Q96NW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD27Q96NW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD27Q96NW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD27Q96NW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD27Q96NW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms